Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
DSC2Q02487 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
DSC2Q02487 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
DSC2Q02487 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
DSC2Q02487 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
DSC2Q02487 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
DSC2Q02487 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
DSC2Q02487 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
DSC2Q02487 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
DSC2Q02487 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
DSC2Q02487 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
DSC2Q02487 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
DSC2Q02487 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
DSC2Q02487 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
DSC2Q02487 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
DSC2Q02487 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
DSC2Q02487 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
DSC2Q02487 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
DSC2Q02487 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
DSC2Q02487 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
DSC2Q02487 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
DSC2Q02487 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
DSC2Q02487 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
DSC2Q02487 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
DSC2Q02487 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
DSC2Q02487 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
DSC2Q02487 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
DSC2Q02487 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
DSC2Q02487 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
DSC2Q02487 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
DSC2Q02487 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
DSC2Q02487 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
DSC2Q02487 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
DSC2Q02487 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
DSC2Q02487 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
DSC2Q02487 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
DSC2Q02487 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
DSC2Q02487 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
DSC2Q02487 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
DSC2Q02487 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
DSC2Q02487 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
DSC2Q02487 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
DSC2Q02487 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
DSC2Q02487 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
DSC2Q02487 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
DSC2Q02487 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
DSC2Q02487 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
DSC2Q02487 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
DSC2Q02487 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
DSC2Q02487 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
DSC2Q02487 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
DSC2Q02487 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
DSC2Q02487 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
DSC2Q02487 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
DSC2Q02487 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
DSC2Q02487 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
DSC2Q02487 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
DSC2Q02487 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
DSC2Q02487 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
DSC2Q02487 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
DSC2Q02487 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
DSC2Q02487 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
DSC2Q02487 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
DSC2Q02487 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
DSC2Q02487 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
DSC2Q02487 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
DSC2Q02487 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
DSC2Q02487 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
DSC2Q02487 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
DSC2Q02487 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
DSC2Q02487 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
DSC2Q02487 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
DSC2Q02487 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
DSC2Q02487 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
DSC2Q02487 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
DSC2Q02487 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
DSC2Q02487 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
DSC2Q02487 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
DSC2Q02487 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
DSC2Q02487 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
DSC2Q02487 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
DSC2Q02487 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
DSC2Q02487 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
DSC2Q02487 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
DSC2Q02487 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
DSC2Q02487 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
DSC2Q02487 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
DSC2Q02487 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
DSC2Q02487 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
DSC2Q02487 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
DSC2Q02487 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
DSC2Q02487 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
DSC2Q02487 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
DSC2Q02487 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
DSC2Q02487 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
DSC2Q02487 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
DSC2Q02487 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
DSC2Q02487 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
DSC2Q02487 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
DSC2Q02487 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms