Protein–RNA interactions for Protein: Q01780

EXOSC10, Exosome component 10, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 885 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC10Q01780 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EXOSC10Q01780 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EXOSC10Q01780 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
EXOSC10Q01780 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EXOSC10Q01780 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
EXOSC10Q01780 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EXOSC10Q01780 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EXOSC10Q01780 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EXOSC10Q01780 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EXOSC10Q01780 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EXOSC10Q01780 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EXOSC10Q01780 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EXOSC10Q01780 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EXOSC10Q01780 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EXOSC10Q01780 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EXOSC10Q01780 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EXOSC10Q01780 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EXOSC10Q01780 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EXOSC10Q01780 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EXOSC10Q01780 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EXOSC10Q01780 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EXOSC10Q01780 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EXOSC10Q01780 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EXOSC10Q01780 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EXOSC10Q01780 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EXOSC10Q01780 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EXOSC10Q01780 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EXOSC10Q01780 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EXOSC10Q01780 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EXOSC10Q01780 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EXOSC10Q01780 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EXOSC10Q01780 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EXOSC10Q01780 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EXOSC10Q01780 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
EXOSC10Q01780 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
EXOSC10Q01780 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EXOSC10Q01780 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EXOSC10Q01780 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EXOSC10Q01780 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EXOSC10Q01780 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EXOSC10Q01780 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EXOSC10Q01780 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EXOSC10Q01780 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EXOSC10Q01780 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EXOSC10Q01780 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EXOSC10Q01780 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EXOSC10Q01780 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EXOSC10Q01780 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EXOSC10Q01780 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EXOSC10Q01780 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EXOSC10Q01780 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EXOSC10Q01780 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EXOSC10Q01780 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EXOSC10Q01780 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EXOSC10Q01780 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EXOSC10Q01780 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EXOSC10Q01780 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EXOSC10Q01780 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EXOSC10Q01780 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EXOSC10Q01780 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EXOSC10Q01780 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EXOSC10Q01780 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EXOSC10Q01780 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EXOSC10Q01780 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EXOSC10Q01780 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EXOSC10Q01780 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EXOSC10Q01780 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EXOSC10Q01780 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EXOSC10Q01780 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EXOSC10Q01780 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EXOSC10Q01780 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EXOSC10Q01780 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EXOSC10Q01780 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EXOSC10Q01780 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EXOSC10Q01780 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EXOSC10Q01780 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EXOSC10Q01780 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EXOSC10Q01780 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EXOSC10Q01780 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EXOSC10Q01780 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EXOSC10Q01780 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EXOSC10Q01780 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EXOSC10Q01780 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EXOSC10Q01780 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EXOSC10Q01780 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EXOSC10Q01780 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC23■■□□□ 1.27
EXOSC10Q01780 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
EXOSC10Q01780 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
EXOSC10Q01780 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EXOSC10Q01780 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
EXOSC10Q01780 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EXOSC10Q01780 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
EXOSC10Q01780 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
EXOSC10Q01780 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
EXOSC10Q01780 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EXOSC10Q01780 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC23■■□□□ 1.27
EXOSC10Q01780 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EXOSC10Q01780 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
EXOSC10Q01780 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
EXOSC10Q01780 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms