Protein–RNA interactions for Protein: Q00597

FANCC, Fanconi anemia group C protein, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCCQ00597 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FANCCQ00597 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FANCCQ00597 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FANCCQ00597 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FANCCQ00597 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FANCCQ00597 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FANCCQ00597 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FANCCQ00597 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FANCCQ00597 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FANCCQ00597 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FANCCQ00597 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FANCCQ00597 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FANCCQ00597 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FANCCQ00597 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FANCCQ00597 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FANCCQ00597 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FANCCQ00597 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FANCCQ00597 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FANCCQ00597 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FANCCQ00597 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FANCCQ00597 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FANCCQ00597 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FANCCQ00597 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
FANCCQ00597 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FANCCQ00597 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FANCCQ00597 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FANCCQ00597 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FANCCQ00597 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FANCCQ00597 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FANCCQ00597 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FANCCQ00597 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FANCCQ00597 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FANCCQ00597 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FANCCQ00597 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FANCCQ00597 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FANCCQ00597 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FANCCQ00597 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FANCCQ00597 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FANCCQ00597 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FANCCQ00597 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FANCCQ00597 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FANCCQ00597 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FANCCQ00597 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FANCCQ00597 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FANCCQ00597 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FANCCQ00597 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FANCCQ00597 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
FANCCQ00597 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FANCCQ00597 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FANCCQ00597 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FANCCQ00597 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FANCCQ00597 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FANCCQ00597 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
FANCCQ00597 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FANCCQ00597 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FANCCQ00597 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FANCCQ00597 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FANCCQ00597 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FANCCQ00597 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FANCCQ00597 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FANCCQ00597 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FANCCQ00597 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FANCCQ00597 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FANCCQ00597 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FANCCQ00597 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FANCCQ00597 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FANCCQ00597 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FANCCQ00597 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FANCCQ00597 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FANCCQ00597 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FANCCQ00597 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FANCCQ00597 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FANCCQ00597 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FANCCQ00597 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FANCCQ00597 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FANCCQ00597 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FANCCQ00597 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FANCCQ00597 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FANCCQ00597 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FANCCQ00597 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FANCCQ00597 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FANCCQ00597 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FANCCQ00597 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FANCCQ00597 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FANCCQ00597 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FANCCQ00597 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
FANCCQ00597 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FANCCQ00597 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FANCCQ00597 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FANCCQ00597 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FANCCQ00597 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FANCCQ00597 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FANCCQ00597 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FANCCQ00597 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FANCCQ00597 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FANCCQ00597 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FANCCQ00597 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FANCCQ00597 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
FANCCQ00597 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FANCCQ00597 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms