Protein–RNA interactions for Protein: P51654

GPC3, Glypican-3, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC3P51654 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GPC3P51654 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GPC3P51654 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GPC3P51654 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GPC3P51654 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GPC3P51654 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GPC3P51654 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GPC3P51654 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GPC3P51654 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GPC3P51654 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GPC3P51654 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GPC3P51654 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
GPC3P51654 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GPC3P51654 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GPC3P51654 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GPC3P51654 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GPC3P51654 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
GPC3P51654 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GPC3P51654 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GPC3P51654 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GPC3P51654 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GPC3P51654 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GPC3P51654 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GPC3P51654 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GPC3P51654 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GPC3P51654 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GPC3P51654 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GPC3P51654 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GPC3P51654 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GPC3P51654 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GPC3P51654 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GPC3P51654 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GPC3P51654 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GPC3P51654 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GPC3P51654 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GPC3P51654 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GPC3P51654 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
GPC3P51654 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GPC3P51654 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GPC3P51654 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GPC3P51654 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GPC3P51654 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GPC3P51654 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GPC3P51654 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GPC3P51654 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GPC3P51654 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GPC3P51654 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GPC3P51654 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GPC3P51654 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
GPC3P51654 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GPC3P51654 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GPC3P51654 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GPC3P51654 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GPC3P51654 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GPC3P51654 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GPC3P51654 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GPC3P51654 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GPC3P51654 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GPC3P51654 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GPC3P51654 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GPC3P51654 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
GPC3P51654 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GPC3P51654 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GPC3P51654 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GPC3P51654 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
GPC3P51654 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GPC3P51654 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GPC3P51654 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GPC3P51654 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GPC3P51654 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GPC3P51654 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GPC3P51654 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GPC3P51654 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GPC3P51654 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GPC3P51654 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GPC3P51654 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GPC3P51654 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GPC3P51654 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GPC3P51654 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
GPC3P51654 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GPC3P51654 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
GPC3P51654 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GPC3P51654 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GPC3P51654 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
GPC3P51654 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GPC3P51654 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GPC3P51654 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GPC3P51654 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GPC3P51654 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GPC3P51654 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GPC3P51654 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GPC3P51654 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GPC3P51654 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GPC3P51654 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GPC3P51654 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GPC3P51654 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GPC3P51654 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GPC3P51654 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GPC3P51654 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
GPC3P51654 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms