Protein–RNA interactions for Protein: P51571

SSR4, Translocon-associated protein subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR4P51571 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSR4P51571 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SSR4P51571 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSR4P51571 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSR4P51571 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSR4P51571 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSR4P51571 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSR4P51571 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSR4P51571 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSR4P51571 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSR4P51571 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSR4P51571 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSR4P51571 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSR4P51571 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSR4P51571 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSR4P51571 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSR4P51571 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SSR4P51571 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SSR4P51571 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SSR4P51571 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SSR4P51571 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SSR4P51571 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SSR4P51571 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SSR4P51571 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SSR4P51571 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SSR4P51571 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SSR4P51571 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SSR4P51571 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SSR4P51571 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SSR4P51571 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SSR4P51571 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SSR4P51571 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SSR4P51571 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SSR4P51571 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SSR4P51571 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SSR4P51571 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SSR4P51571 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SSR4P51571 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SSR4P51571 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SSR4P51571 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SSR4P51571 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SSR4P51571 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SSR4P51571 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SSR4P51571 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SSR4P51571 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SSR4P51571 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SSR4P51571 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SSR4P51571 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSR4P51571 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSR4P51571 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSR4P51571 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSR4P51571 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSR4P51571 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSR4P51571 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SSR4P51571 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSR4P51571 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSR4P51571 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSR4P51571 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSR4P51571 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSR4P51571 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSR4P51571 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSR4P51571 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SSR4P51571 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSR4P51571 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSR4P51571 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSR4P51571 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSR4P51571 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSR4P51571 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSR4P51571 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSR4P51571 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSR4P51571 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSR4P51571 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SSR4P51571 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SSR4P51571 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
SSR4P51571 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SSR4P51571 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SSR4P51571 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SSR4P51571 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SSR4P51571 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SSR4P51571 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SSR4P51571 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SSR4P51571 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SSR4P51571 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SSR4P51571 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SSR4P51571 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
SSR4P51571 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SSR4P51571 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SSR4P51571 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SSR4P51571 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SSR4P51571 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SSR4P51571 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SSR4P51571 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SSR4P51571 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SSR4P51571 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SSR4P51571 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SSR4P51571 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SSR4P51571 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SSR4P51571 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SSR4P51571 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SSR4P51571 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms