Protein–RNA interactions for Protein: P41219

PRPH, Peripherin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPHP41219 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRPHP41219 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRPHP41219 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRPHP41219 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRPHP41219 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRPHP41219 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRPHP41219 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRPHP41219 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRPHP41219 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRPHP41219 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRPHP41219 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRPHP41219 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRPHP41219 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRPHP41219 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRPHP41219 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PRPHP41219 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRPHP41219 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRPHP41219 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRPHP41219 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRPHP41219 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRPHP41219 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PRPHP41219 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRPHP41219 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRPHP41219 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRPHP41219 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRPHP41219 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRPHP41219 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRPHP41219 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRPHP41219 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRPHP41219 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRPHP41219 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRPHP41219 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRPHP41219 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRPHP41219 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRPHP41219 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRPHP41219 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRPHP41219 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRPHP41219 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRPHP41219 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRPHP41219 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRPHP41219 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRPHP41219 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRPHP41219 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRPHP41219 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRPHP41219 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRPHP41219 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRPHP41219 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRPHP41219 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRPHP41219 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRPHP41219 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRPHP41219 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRPHP41219 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRPHP41219 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRPHP41219 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRPHP41219 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRPHP41219 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRPHP41219 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PRPHP41219 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRPHP41219 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRPHP41219 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRPHP41219 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRPHP41219 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRPHP41219 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRPHP41219 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRPHP41219 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRPHP41219 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRPHP41219 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRPHP41219 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRPHP41219 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRPHP41219 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRPHP41219 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRPHP41219 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRPHP41219 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRPHP41219 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRPHP41219 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRPHP41219 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRPHP41219 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRPHP41219 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRPHP41219 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRPHP41219 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRPHP41219 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRPHP41219 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRPHP41219 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRPHP41219 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRPHP41219 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRPHP41219 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRPHP41219 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRPHP41219 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRPHP41219 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRPHP41219 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRPHP41219 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRPHP41219 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRPHP41219 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRPHP41219 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRPHP41219 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRPHP41219 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRPHP41219 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRPHP41219 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRPHP41219 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRPHP41219 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms