Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXC13P31276 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXC13P31276 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXC13P31276 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXC13P31276 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXC13P31276 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXC13P31276 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXC13P31276 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXC13P31276 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXC13P31276 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXC13P31276 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXC13P31276 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXC13P31276 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXC13P31276 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXC13P31276 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXC13P31276 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXC13P31276 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXC13P31276 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXC13P31276 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXC13P31276 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXC13P31276 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXC13P31276 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXC13P31276 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXC13P31276 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXC13P31276 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXC13P31276 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXC13P31276 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXC13P31276 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXC13P31276 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXC13P31276 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXC13P31276 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXC13P31276 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXC13P31276 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXC13P31276 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXC13P31276 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXC13P31276 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXC13P31276 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXC13P31276 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXC13P31276 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXC13P31276 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXC13P31276 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXC13P31276 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXC13P31276 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXC13P31276 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXC13P31276 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXC13P31276 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXC13P31276 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXC13P31276 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXC13P31276 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXC13P31276 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXC13P31276 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXC13P31276 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXC13P31276 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXC13P31276 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXC13P31276 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXC13P31276 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXC13P31276 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXC13P31276 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXC13P31276 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXC13P31276 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXC13P31276 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXC13P31276 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXC13P31276 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXC13P31276 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXC13P31276 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXC13P31276 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXC13P31276 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXC13P31276 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXC13P31276 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXC13P31276 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXC13P31276 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXC13P31276 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXC13P31276 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXC13P31276 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXC13P31276 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXC13P31276 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXC13P31276 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXC13P31276 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXC13P31276 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXC13P31276 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXC13P31276 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXC13P31276 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXC13P31276 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXC13P31276 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXC13P31276 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXC13P31276 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXC13P31276 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXC13P31276 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXC13P31276 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXC13P31276 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXC13P31276 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXC13P31276 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXC13P31276 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXC13P31276 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXC13P31276 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXC13P31276 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXC13P31276 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXC13P31276 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXC13P31276 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXC13P31276 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms