Protein–RNA interactions for Protein: P30532

CHRNA5, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA5P30532 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHRNA5P30532 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHRNA5P30532 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHRNA5P30532 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHRNA5P30532 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHRNA5P30532 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CHRNA5P30532 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHRNA5P30532 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHRNA5P30532 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHRNA5P30532 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHRNA5P30532 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHRNA5P30532 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHRNA5P30532 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHRNA5P30532 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHRNA5P30532 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHRNA5P30532 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHRNA5P30532 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHRNA5P30532 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHRNA5P30532 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHRNA5P30532 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHRNA5P30532 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHRNA5P30532 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHRNA5P30532 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHRNA5P30532 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHRNA5P30532 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHRNA5P30532 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHRNA5P30532 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHRNA5P30532 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHRNA5P30532 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHRNA5P30532 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHRNA5P30532 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHRNA5P30532 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHRNA5P30532 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHRNA5P30532 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CHRNA5P30532 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHRNA5P30532 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHRNA5P30532 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHRNA5P30532 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHRNA5P30532 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHRNA5P30532 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHRNA5P30532 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHRNA5P30532 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHRNA5P30532 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHRNA5P30532 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHRNA5P30532 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHRNA5P30532 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHRNA5P30532 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHRNA5P30532 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CHRNA5P30532 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHRNA5P30532 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHRNA5P30532 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHRNA5P30532 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHRNA5P30532 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHRNA5P30532 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CHRNA5P30532 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHRNA5P30532 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHRNA5P30532 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHRNA5P30532 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CHRNA5P30532 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CHRNA5P30532 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHRNA5P30532 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHRNA5P30532 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHRNA5P30532 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHRNA5P30532 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHRNA5P30532 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CHRNA5P30532 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHRNA5P30532 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHRNA5P30532 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHRNA5P30532 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CHRNA5P30532 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHRNA5P30532 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHRNA5P30532 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHRNA5P30532 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHRNA5P30532 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHRNA5P30532 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHRNA5P30532 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHRNA5P30532 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHRNA5P30532 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHRNA5P30532 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHRNA5P30532 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHRNA5P30532 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHRNA5P30532 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHRNA5P30532 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHRNA5P30532 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CHRNA5P30532 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CHRNA5P30532 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHRNA5P30532 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHRNA5P30532 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHRNA5P30532 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHRNA5P30532 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CHRNA5P30532 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHRNA5P30532 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHRNA5P30532 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHRNA5P30532 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHRNA5P30532 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHRNA5P30532 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHRNA5P30532 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHRNA5P30532 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHRNA5P30532 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHRNA5P30532 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms