Protein–RNA interactions for Protein: P29016

CD1B, T-cell surface glycoprotein CD1b, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD1BP29016 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD1BP29016 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD1BP29016 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD1BP29016 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CD1BP29016 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD1BP29016 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD1BP29016 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD1BP29016 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD1BP29016 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD1BP29016 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD1BP29016 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD1BP29016 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD1BP29016 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD1BP29016 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD1BP29016 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD1BP29016 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CD1BP29016 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD1BP29016 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD1BP29016 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD1BP29016 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD1BP29016 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD1BP29016 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD1BP29016 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD1BP29016 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD1BP29016 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD1BP29016 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD1BP29016 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD1BP29016 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD1BP29016 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD1BP29016 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD1BP29016 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD1BP29016 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD1BP29016 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD1BP29016 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD1BP29016 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD1BP29016 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD1BP29016 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD1BP29016 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD1BP29016 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD1BP29016 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD1BP29016 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD1BP29016 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD1BP29016 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD1BP29016 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD1BP29016 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD1BP29016 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD1BP29016 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD1BP29016 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD1BP29016 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD1BP29016 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD1BP29016 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD1BP29016 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD1BP29016 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD1BP29016 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD1BP29016 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD1BP29016 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD1BP29016 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD1BP29016 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD1BP29016 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD1BP29016 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD1BP29016 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD1BP29016 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CD1BP29016 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CD1BP29016 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CD1BP29016 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD1BP29016 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD1BP29016 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD1BP29016 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD1BP29016 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD1BP29016 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD1BP29016 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD1BP29016 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD1BP29016 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CD1BP29016 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CD1BP29016 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD1BP29016 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD1BP29016 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD1BP29016 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD1BP29016 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD1BP29016 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD1BP29016 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD1BP29016 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD1BP29016 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD1BP29016 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD1BP29016 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD1BP29016 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD1BP29016 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD1BP29016 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD1BP29016 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD1BP29016 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD1BP29016 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD1BP29016 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD1BP29016 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD1BP29016 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD1BP29016 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD1BP29016 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD1BP29016 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD1BP29016 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD1BP29016 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD1BP29016 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms