Protein–RNA interactions for Protein: P23634

ATP2B4, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B4P23634 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP2B4P23634 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP2B4P23634 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP2B4P23634 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP2B4P23634 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP2B4P23634 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP2B4P23634 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP2B4P23634 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP2B4P23634 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP2B4P23634 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP2B4P23634 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP2B4P23634 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP2B4P23634 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP2B4P23634 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP2B4P23634 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP2B4P23634 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP2B4P23634 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP2B4P23634 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP2B4P23634 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP2B4P23634 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP2B4P23634 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP2B4P23634 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP2B4P23634 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP2B4P23634 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP2B4P23634 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP2B4P23634 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP2B4P23634 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP2B4P23634 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP2B4P23634 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP2B4P23634 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP2B4P23634 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP2B4P23634 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP2B4P23634 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATP2B4P23634 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATP2B4P23634 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATP2B4P23634 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATP2B4P23634 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATP2B4P23634 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATP2B4P23634 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATP2B4P23634 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
ATP2B4P23634 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATP2B4P23634 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATP2B4P23634 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATP2B4P23634 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATP2B4P23634 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATP2B4P23634 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATP2B4P23634 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATP2B4P23634 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATP2B4P23634 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATP2B4P23634 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATP2B4P23634 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATP2B4P23634 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATP2B4P23634 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATP2B4P23634 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATP2B4P23634 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATP2B4P23634 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATP2B4P23634 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATP2B4P23634 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
ATP2B4P23634 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATP2B4P23634 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
ATP2B4P23634 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATP2B4P23634 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATP2B4P23634 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATP2B4P23634 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATP2B4P23634 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATP2B4P23634 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATP2B4P23634 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATP2B4P23634 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATP2B4P23634 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATP2B4P23634 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATP2B4P23634 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATP2B4P23634 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATP2B4P23634 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATP2B4P23634 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATP2B4P23634 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
ATP2B4P23634 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
ATP2B4P23634 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATP2B4P23634 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATP2B4P23634 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATP2B4P23634 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATP2B4P23634 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATP2B4P23634 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATP2B4P23634 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATP2B4P23634 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATP2B4P23634 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATP2B4P23634 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATP2B4P23634 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
ATP2B4P23634 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATP2B4P23634 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATP2B4P23634 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATP2B4P23634 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATP2B4P23634 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATP2B4P23634 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ATP2B4P23634 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ATP2B4P23634 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ATP2B4P23634 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATP2B4P23634 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATP2B4P23634 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATP2B4P23634 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATP2B4P23634 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms