Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Length 700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPREP23469 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPREP23469 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPREP23469 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPREP23469 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPREP23469 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPREP23469 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPREP23469 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPREP23469 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPREP23469 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPREP23469 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPREP23469 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPREP23469 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPREP23469 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPREP23469 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPREP23469 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPREP23469 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPREP23469 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPREP23469 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPREP23469 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPREP23469 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPREP23469 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPREP23469 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPREP23469 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPREP23469 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPREP23469 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPREP23469 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPREP23469 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPREP23469 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPREP23469 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPREP23469 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPREP23469 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPREP23469 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPREP23469 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPREP23469 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPREP23469 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPREP23469 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPREP23469 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPREP23469 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPREP23469 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPREP23469 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPREP23469 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPREP23469 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPREP23469 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPREP23469 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPREP23469 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPREP23469 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPREP23469 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPREP23469 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPREP23469 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPREP23469 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPREP23469 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPREP23469 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPREP23469 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPREP23469 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPREP23469 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPREP23469 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPREP23469 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPREP23469 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPREP23469 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPREP23469 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPREP23469 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPREP23469 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPREP23469 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPREP23469 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPREP23469 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPREP23469 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPREP23469 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPREP23469 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPREP23469 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPREP23469 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPREP23469 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPREP23469 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPREP23469 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPREP23469 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPREP23469 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPREP23469 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPREP23469 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPREP23469 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPREP23469 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPREP23469 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPREP23469 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPREP23469 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPREP23469 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPREP23469 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPREP23469 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPREP23469 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPREP23469 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPREP23469 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPREP23469 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPREP23469 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPREP23469 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPREP23469 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPREP23469 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPREP23469 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPREP23469 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPREP23469 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPREP23469 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPREP23469 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPREP23469 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
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