Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ITGA6P23229 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ITGA6P23229 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ITGA6P23229 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ITGA6P23229 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ITGA6P23229 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ITGA6P23229 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ITGA6P23229 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ITGA6P23229 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ITGA6P23229 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ITGA6P23229 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ITGA6P23229 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ITGA6P23229 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ITGA6P23229 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ITGA6P23229 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ITGA6P23229 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ITGA6P23229 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ITGA6P23229 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ITGA6P23229 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ITGA6P23229 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ITGA6P23229 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ITGA6P23229 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ITGA6P23229 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ITGA6P23229 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ITGA6P23229 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ITGA6P23229 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ITGA6P23229 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ITGA6P23229 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ITGA6P23229 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ITGA6P23229 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ITGA6P23229 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ITGA6P23229 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ITGA6P23229 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ITGA6P23229 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ITGA6P23229 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ITGA6P23229 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ITGA6P23229 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ITGA6P23229 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ITGA6P23229 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ITGA6P23229 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ITGA6P23229 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ITGA6P23229 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ITGA6P23229 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ITGA6P23229 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ITGA6P23229 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ITGA6P23229 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ITGA6P23229 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ITGA6P23229 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ITGA6P23229 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ITGA6P23229 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ITGA6P23229 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ITGA6P23229 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ITGA6P23229 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ITGA6P23229 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ITGA6P23229 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ITGA6P23229 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ITGA6P23229 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
ITGA6P23229 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ITGA6P23229 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ITGA6P23229 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ITGA6P23229 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ITGA6P23229 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ITGA6P23229 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ITGA6P23229 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ITGA6P23229 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ITGA6P23229 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ITGA6P23229 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ITGA6P23229 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ITGA6P23229 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ITGA6P23229 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ITGA6P23229 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ITGA6P23229 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ITGA6P23229 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ITGA6P23229 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ITGA6P23229 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ITGA6P23229 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ITGA6P23229 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ITGA6P23229 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ITGA6P23229 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ITGA6P23229 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ITGA6P23229 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ITGA6P23229 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ITGA6P23229 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ITGA6P23229 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ITGA6P23229 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ITGA6P23229 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ITGA6P23229 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ITGA6P23229 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ITGA6P23229 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ITGA6P23229 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ITGA6P23229 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ITGA6P23229 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ITGA6P23229 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ITGA6P23229 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ITGA6P23229 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ITGA6P23229 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ITGA6P23229 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ITGA6P23229 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ITGA6P23229 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ITGA6P23229 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms