Protein–RNA interactions for Protein: P12755

SKI, Ski oncogene, humanhuman

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIP12755 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SKIP12755 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SKIP12755 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SKIP12755 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SKIP12755 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SKIP12755 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SKIP12755 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SKIP12755 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SKIP12755 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SKIP12755 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SKIP12755 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SKIP12755 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SKIP12755 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SKIP12755 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SKIP12755 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SKIP12755 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SKIP12755 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SKIP12755 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SKIP12755 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SKIP12755 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SKIP12755 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SKIP12755 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SKIP12755 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SKIP12755 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SKIP12755 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SKIP12755 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SKIP12755 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SKIP12755 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SKIP12755 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SKIP12755 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SKIP12755 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SKIP12755 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SKIP12755 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SKIP12755 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SKIP12755 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SKIP12755 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SKIP12755 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SKIP12755 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SKIP12755 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SKIP12755 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SKIP12755 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SKIP12755 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SKIP12755 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SKIP12755 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SKIP12755 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SKIP12755 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SKIP12755 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SKIP12755 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SKIP12755 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SKIP12755 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SKIP12755 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SKIP12755 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SKIP12755 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SKIP12755 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SKIP12755 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SKIP12755 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SKIP12755 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SKIP12755 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SKIP12755 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SKIP12755 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SKIP12755 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SKIP12755 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SKIP12755 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SKIP12755 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SKIP12755 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SKIP12755 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SKIP12755 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SKIP12755 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SKIP12755 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SKIP12755 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SKIP12755 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SKIP12755 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SKIP12755 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SKIP12755 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SKIP12755 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SKIP12755 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SKIP12755 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SKIP12755 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SKIP12755 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SKIP12755 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SKIP12755 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SKIP12755 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SKIP12755 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SKIP12755 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SKIP12755 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SKIP12755 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SKIP12755 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SKIP12755 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SKIP12755 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SKIP12755 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SKIP12755 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SKIP12755 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SKIP12755 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SKIP12755 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SKIP12755 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SKIP12755 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SKIP12755 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SKIP12755 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SKIP12755 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SKIP12755 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms