Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
POLR1AO95602 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
POLR1AO95602 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
POLR1AO95602 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
POLR1AO95602 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
POLR1AO95602 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
POLR1AO95602 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
POLR1AO95602 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
POLR1AO95602 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
POLR1AO95602 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
POLR1AO95602 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
POLR1AO95602 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
POLR1AO95602 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
POLR1AO95602 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
POLR1AO95602 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
POLR1AO95602 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
POLR1AO95602 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
POLR1AO95602 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
POLR1AO95602 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
POLR1AO95602 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
POLR1AO95602 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
POLR1AO95602 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
POLR1AO95602 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
POLR1AO95602 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
POLR1AO95602 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
POLR1AO95602 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
POLR1AO95602 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
POLR1AO95602 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
POLR1AO95602 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
POLR1AO95602 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
POLR1AO95602 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
POLR1AO95602 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
POLR1AO95602 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
POLR1AO95602 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
POLR1AO95602 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
POLR1AO95602 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
POLR1AO95602 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
POLR1AO95602 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
POLR1AO95602 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
POLR1AO95602 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
POLR1AO95602 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
POLR1AO95602 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
POLR1AO95602 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
POLR1AO95602 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
POLR1AO95602 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
POLR1AO95602 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
POLR1AO95602 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
POLR1AO95602 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
POLR1AO95602 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
POLR1AO95602 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
POLR1AO95602 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
POLR1AO95602 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
POLR1AO95602 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
POLR1AO95602 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
POLR1AO95602 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
POLR1AO95602 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
POLR1AO95602 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
POLR1AO95602 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
POLR1AO95602 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
POLR1AO95602 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC28.59■■■□□ 2.17
POLR1AO95602 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
POLR1AO95602 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
POLR1AO95602 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
POLR1AO95602 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
POLR1AO95602 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
POLR1AO95602 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
POLR1AO95602 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
POLR1AO95602 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
POLR1AO95602 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
POLR1AO95602 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
POLR1AO95602 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
POLR1AO95602 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
POLR1AO95602 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
POLR1AO95602 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
POLR1AO95602 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
POLR1AO95602 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
POLR1AO95602 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
POLR1AO95602 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
POLR1AO95602 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
POLR1AO95602 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
POLR1AO95602 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
POLR1AO95602 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
POLR1AO95602 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
POLR1AO95602 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
POLR1AO95602 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
POLR1AO95602 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
POLR1AO95602 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
POLR1AO95602 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
POLR1AO95602 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
POLR1AO95602 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
POLR1AO95602 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.57■■■□□ 2.16
POLR1AO95602 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
POLR1AO95602 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
POLR1AO95602 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
POLR1AO95602 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
POLR1AO95602 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
POLR1AO95602 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
POLR1AO95602 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
POLR1AO95602 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
POLR1AO95602 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms