Protein–RNA interactions for Protein: O94759

TRPM2, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPM2O94759 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TRPM2O94759 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TRPM2O94759 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
TRPM2O94759 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TRPM2O94759 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TRPM2O94759 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
TRPM2O94759 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
TRPM2O94759 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TRPM2O94759 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TRPM2O94759 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TRPM2O94759 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TRPM2O94759 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TRPM2O94759 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
TRPM2O94759 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TRPM2O94759 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TRPM2O94759 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TRPM2O94759 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TRPM2O94759 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TRPM2O94759 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TRPM2O94759 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TRPM2O94759 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TRPM2O94759 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TRPM2O94759 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TRPM2O94759 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TRPM2O94759 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TRPM2O94759 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TRPM2O94759 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TRPM2O94759 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
TRPM2O94759 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TRPM2O94759 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TRPM2O94759 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TRPM2O94759 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TRPM2O94759 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TRPM2O94759 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TRPM2O94759 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TRPM2O94759 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TRPM2O94759 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TRPM2O94759 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
TRPM2O94759 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TRPM2O94759 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TRPM2O94759 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
TRPM2O94759 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TRPM2O94759 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TRPM2O94759 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TRPM2O94759 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
TRPM2O94759 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
TRPM2O94759 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
TRPM2O94759 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TRPM2O94759 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TRPM2O94759 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TRPM2O94759 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TRPM2O94759 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TRPM2O94759 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRPM2O94759 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRPM2O94759 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRPM2O94759 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRPM2O94759 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRPM2O94759 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRPM2O94759 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRPM2O94759 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRPM2O94759 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
TRPM2O94759 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRPM2O94759 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRPM2O94759 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRPM2O94759 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRPM2O94759 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRPM2O94759 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRPM2O94759 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRPM2O94759 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRPM2O94759 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRPM2O94759 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRPM2O94759 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRPM2O94759 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRPM2O94759 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRPM2O94759 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRPM2O94759 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRPM2O94759 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRPM2O94759 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRPM2O94759 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRPM2O94759 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRPM2O94759 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRPM2O94759 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
TRPM2O94759 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRPM2O94759 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRPM2O94759 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRPM2O94759 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRPM2O94759 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRPM2O94759 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
TRPM2O94759 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TRPM2O94759 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TRPM2O94759 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TRPM2O94759 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TRPM2O94759 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TRPM2O94759 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TRPM2O94759 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRPM2O94759 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRPM2O94759 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRPM2O94759 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRPM2O94759 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRPM2O94759 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms