Protein–RNA interactions for Protein: O75164

KDM4A, Lysine-specific demethylase 4A, humanhuman

Predictions only

Length 1,064 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM4AO75164 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM4AO75164 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM4AO75164 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM4AO75164 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM4AO75164 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM4AO75164 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM4AO75164 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM4AO75164 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KDM4AO75164 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KDM4AO75164 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KDM4AO75164 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
KDM4AO75164 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KDM4AO75164 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
KDM4AO75164 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KDM4AO75164 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KDM4AO75164 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KDM4AO75164 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KDM4AO75164 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KDM4AO75164 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KDM4AO75164 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KDM4AO75164 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KDM4AO75164 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KDM4AO75164 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
KDM4AO75164 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
KDM4AO75164 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KDM4AO75164 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KDM4AO75164 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KDM4AO75164 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
KDM4AO75164 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KDM4AO75164 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
KDM4AO75164 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KDM4AO75164 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KDM4AO75164 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KDM4AO75164 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KDM4AO75164 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KDM4AO75164 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KDM4AO75164 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KDM4AO75164 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KDM4AO75164 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KDM4AO75164 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KDM4AO75164 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KDM4AO75164 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KDM4AO75164 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KDM4AO75164 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KDM4AO75164 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KDM4AO75164 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KDM4AO75164 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
KDM4AO75164 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KDM4AO75164 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
KDM4AO75164 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KDM4AO75164 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KDM4AO75164 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KDM4AO75164 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KDM4AO75164 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KDM4AO75164 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KDM4AO75164 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KDM4AO75164 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KDM4AO75164 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
KDM4AO75164 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KDM4AO75164 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KDM4AO75164 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KDM4AO75164 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KDM4AO75164 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KDM4AO75164 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KDM4AO75164 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KDM4AO75164 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KDM4AO75164 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KDM4AO75164 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KDM4AO75164 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KDM4AO75164 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KDM4AO75164 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KDM4AO75164 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KDM4AO75164 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KDM4AO75164 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KDM4AO75164 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KDM4AO75164 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KDM4AO75164 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KDM4AO75164 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KDM4AO75164 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KDM4AO75164 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KDM4AO75164 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KDM4AO75164 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
KDM4AO75164 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KDM4AO75164 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KDM4AO75164 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KDM4AO75164 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KDM4AO75164 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KDM4AO75164 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KDM4AO75164 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KDM4AO75164 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KDM4AO75164 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KDM4AO75164 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KDM4AO75164 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KDM4AO75164 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KDM4AO75164 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KDM4AO75164 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KDM4AO75164 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KDM4AO75164 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KDM4AO75164 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KDM4AO75164 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms