Protein–RNA interactions for Protein: O75054

IGSF3, Immunoglobulin superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF3O75054 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IGSF3O75054 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
IGSF3O75054 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
IGSF3O75054 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
IGSF3O75054 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
IGSF3O75054 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
IGSF3O75054 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
IGSF3O75054 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
IGSF3O75054 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
IGSF3O75054 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
IGSF3O75054 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
IGSF3O75054 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
IGSF3O75054 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
IGSF3O75054 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
IGSF3O75054 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
IGSF3O75054 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
IGSF3O75054 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
IGSF3O75054 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
IGSF3O75054 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
IGSF3O75054 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
IGSF3O75054 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
IGSF3O75054 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
IGSF3O75054 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
IGSF3O75054 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
IGSF3O75054 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IGSF3O75054 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IGSF3O75054 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
IGSF3O75054 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IGSF3O75054 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IGSF3O75054 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IGSF3O75054 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IGSF3O75054 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IGSF3O75054 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IGSF3O75054 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
IGSF3O75054 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
IGSF3O75054 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
IGSF3O75054 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
IGSF3O75054 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IGSF3O75054 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IGSF3O75054 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
IGSF3O75054 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IGSF3O75054 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IGSF3O75054 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
IGSF3O75054 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
IGSF3O75054 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IGSF3O75054 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IGSF3O75054 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
IGSF3O75054 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IGSF3O75054 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
IGSF3O75054 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
IGSF3O75054 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
IGSF3O75054 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IGSF3O75054 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
IGSF3O75054 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IGSF3O75054 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IGSF3O75054 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IGSF3O75054 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IGSF3O75054 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
IGSF3O75054 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
IGSF3O75054 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
IGSF3O75054 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
IGSF3O75054 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IGSF3O75054 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
IGSF3O75054 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
IGSF3O75054 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IGSF3O75054 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
IGSF3O75054 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
IGSF3O75054 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
IGSF3O75054 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IGSF3O75054 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IGSF3O75054 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IGSF3O75054 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IGSF3O75054 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
IGSF3O75054 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
IGSF3O75054 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IGSF3O75054 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
IGSF3O75054 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
IGSF3O75054 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
IGSF3O75054 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IGSF3O75054 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IGSF3O75054 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IGSF3O75054 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
IGSF3O75054 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
IGSF3O75054 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
IGSF3O75054 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IGSF3O75054 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IGSF3O75054 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IGSF3O75054 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
IGSF3O75054 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
IGSF3O75054 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
IGSF3O75054 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
IGSF3O75054 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
IGSF3O75054 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
IGSF3O75054 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
IGSF3O75054 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
IGSF3O75054 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IGSF3O75054 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
IGSF3O75054 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
IGSF3O75054 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IGSF3O75054 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms