Protein–RNA interactions for Protein: O60716

CTNND1, Catenin delta-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNND1O60716 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTNND1O60716 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTNND1O60716 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTNND1O60716 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CTNND1O60716 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTNND1O60716 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTNND1O60716 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTNND1O60716 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTNND1O60716 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTNND1O60716 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CTNND1O60716 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTNND1O60716 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CTNND1O60716 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTNND1O60716 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTNND1O60716 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTNND1O60716 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTNND1O60716 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTNND1O60716 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTNND1O60716 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTNND1O60716 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTNND1O60716 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTNND1O60716 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTNND1O60716 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTNND1O60716 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTNND1O60716 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTNND1O60716 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CTNND1O60716 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTNND1O60716 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTNND1O60716 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTNND1O60716 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTNND1O60716 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTNND1O60716 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTNND1O60716 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTNND1O60716 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTNND1O60716 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTNND1O60716 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTNND1O60716 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTNND1O60716 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTNND1O60716 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CTNND1O60716 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTNND1O60716 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTNND1O60716 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTNND1O60716 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTNND1O60716 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTNND1O60716 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTNND1O60716 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTNND1O60716 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTNND1O60716 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTNND1O60716 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTNND1O60716 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTNND1O60716 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTNND1O60716 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTNND1O60716 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTNND1O60716 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTNND1O60716 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CTNND1O60716 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CTNND1O60716 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTNND1O60716 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTNND1O60716 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTNND1O60716 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTNND1O60716 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTNND1O60716 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTNND1O60716 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTNND1O60716 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTNND1O60716 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTNND1O60716 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTNND1O60716 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTNND1O60716 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTNND1O60716 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTNND1O60716 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTNND1O60716 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTNND1O60716 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTNND1O60716 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
CTNND1O60716 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
CTNND1O60716 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTNND1O60716 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTNND1O60716 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CTNND1O60716 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTNND1O60716 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CTNND1O60716 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTNND1O60716 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTNND1O60716 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTNND1O60716 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTNND1O60716 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTNND1O60716 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTNND1O60716 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTNND1O60716 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CTNND1O60716 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTNND1O60716 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTNND1O60716 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTNND1O60716 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTNND1O60716 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTNND1O60716 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTNND1O60716 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTNND1O60716 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CTNND1O60716 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTNND1O60716 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTNND1O60716 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CTNND1O60716 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTNND1O60716 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms