Protein–RNA interactions for Protein: O60391

GRIN3B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN3BO60391 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GRIN3BO60391 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GRIN3BO60391 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GRIN3BO60391 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GRIN3BO60391 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
GRIN3BO60391 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GRIN3BO60391 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GRIN3BO60391 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GRIN3BO60391 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GRIN3BO60391 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GRIN3BO60391 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GRIN3BO60391 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GRIN3BO60391 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GRIN3BO60391 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GRIN3BO60391 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GRIN3BO60391 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GRIN3BO60391 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GRIN3BO60391 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GRIN3BO60391 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GRIN3BO60391 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GRIN3BO60391 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GRIN3BO60391 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
GRIN3BO60391 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GRIN3BO60391 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GRIN3BO60391 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
GRIN3BO60391 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GRIN3BO60391 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GRIN3BO60391 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GRIN3BO60391 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GRIN3BO60391 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GRIN3BO60391 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GRIN3BO60391 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GRIN3BO60391 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GRIN3BO60391 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GRIN3BO60391 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GRIN3BO60391 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GRIN3BO60391 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GRIN3BO60391 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
GRIN3BO60391 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
GRIN3BO60391 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GRIN3BO60391 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GRIN3BO60391 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
GRIN3BO60391 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GRIN3BO60391 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GRIN3BO60391 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GRIN3BO60391 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GRIN3BO60391 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GRIN3BO60391 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GRIN3BO60391 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GRIN3BO60391 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GRIN3BO60391 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GRIN3BO60391 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
GRIN3BO60391 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GRIN3BO60391 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GRIN3BO60391 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GRIN3BO60391 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GRIN3BO60391 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GRIN3BO60391 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GRIN3BO60391 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GRIN3BO60391 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GRIN3BO60391 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GRIN3BO60391 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GRIN3BO60391 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GRIN3BO60391 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GRIN3BO60391 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GRIN3BO60391 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
GRIN3BO60391 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GRIN3BO60391 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GRIN3BO60391 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC24■■□□□ 1.43
GRIN3BO60391 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GRIN3BO60391 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
GRIN3BO60391 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GRIN3BO60391 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GRIN3BO60391 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GRIN3BO60391 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GRIN3BO60391 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
GRIN3BO60391 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
GRIN3BO60391 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GRIN3BO60391 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GRIN3BO60391 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC24■■□□□ 1.43
GRIN3BO60391 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC24■■□□□ 1.43
GRIN3BO60391 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GRIN3BO60391 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GRIN3BO60391 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GRIN3BO60391 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GRIN3BO60391 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GRIN3BO60391 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
GRIN3BO60391 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GRIN3BO60391 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
GRIN3BO60391 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GRIN3BO60391 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GRIN3BO60391 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GRIN3BO60391 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GRIN3BO60391 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GRIN3BO60391 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GRIN3BO60391 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GRIN3BO60391 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GRIN3BO60391 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GRIN3BO60391 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
GRIN3BO60391 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms