Protein–RNA interactions for Protein: O43283

MAP3K13, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 13, humanhuman

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K13O43283 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MAP3K13O43283 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MAP3K13O43283 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MAP3K13O43283 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MAP3K13O43283 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MAP3K13O43283 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MAP3K13O43283 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MAP3K13O43283 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MAP3K13O43283 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MAP3K13O43283 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MAP3K13O43283 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MAP3K13O43283 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MAP3K13O43283 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MAP3K13O43283 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MAP3K13O43283 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MAP3K13O43283 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MAP3K13O43283 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
MAP3K13O43283 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MAP3K13O43283 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
MAP3K13O43283 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MAP3K13O43283 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MAP3K13O43283 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MAP3K13O43283 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MAP3K13O43283 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MAP3K13O43283 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MAP3K13O43283 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MAP3K13O43283 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MAP3K13O43283 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MAP3K13O43283 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MAP3K13O43283 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MAP3K13O43283 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MAP3K13O43283 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MAP3K13O43283 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MAP3K13O43283 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MAP3K13O43283 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MAP3K13O43283 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MAP3K13O43283 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MAP3K13O43283 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MAP3K13O43283 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MAP3K13O43283 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MAP3K13O43283 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MAP3K13O43283 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MAP3K13O43283 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MAP3K13O43283 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MAP3K13O43283 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MAP3K13O43283 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MAP3K13O43283 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MAP3K13O43283 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MAP3K13O43283 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MAP3K13O43283 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MAP3K13O43283 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MAP3K13O43283 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MAP3K13O43283 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MAP3K13O43283 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MAP3K13O43283 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MAP3K13O43283 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MAP3K13O43283 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
MAP3K13O43283 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MAP3K13O43283 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MAP3K13O43283 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
MAP3K13O43283 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MAP3K13O43283 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MAP3K13O43283 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MAP3K13O43283 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MAP3K13O43283 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MAP3K13O43283 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MAP3K13O43283 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MAP3K13O43283 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MAP3K13O43283 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
MAP3K13O43283 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MAP3K13O43283 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MAP3K13O43283 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MAP3K13O43283 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MAP3K13O43283 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MAP3K13O43283 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MAP3K13O43283 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MAP3K13O43283 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MAP3K13O43283 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MAP3K13O43283 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MAP3K13O43283 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MAP3K13O43283 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MAP3K13O43283 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MAP3K13O43283 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MAP3K13O43283 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
MAP3K13O43283 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
MAP3K13O43283 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MAP3K13O43283 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MAP3K13O43283 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MAP3K13O43283 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MAP3K13O43283 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MAP3K13O43283 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MAP3K13O43283 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MAP3K13O43283 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MAP3K13O43283 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MAP3K13O43283 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MAP3K13O43283 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MAP3K13O43283 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MAP3K13O43283 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MAP3K13O43283 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MAP3K13O43283 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms