Protein–RNA interactions for Protein: O14727

APAF1, Apoptotic protease-activating factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APAF1O14727 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
APAF1O14727 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
APAF1O14727 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
APAF1O14727 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
APAF1O14727 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
APAF1O14727 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
APAF1O14727 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
APAF1O14727 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
APAF1O14727 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
APAF1O14727 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
APAF1O14727 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
APAF1O14727 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
APAF1O14727 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
APAF1O14727 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
APAF1O14727 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
APAF1O14727 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
APAF1O14727 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
APAF1O14727 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
APAF1O14727 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
APAF1O14727 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
APAF1O14727 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
APAF1O14727 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
APAF1O14727 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
APAF1O14727 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
APAF1O14727 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
APAF1O14727 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
APAF1O14727 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
APAF1O14727 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
APAF1O14727 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
APAF1O14727 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
APAF1O14727 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
APAF1O14727 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
APAF1O14727 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
APAF1O14727 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
APAF1O14727 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
APAF1O14727 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
APAF1O14727 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
APAF1O14727 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
APAF1O14727 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
APAF1O14727 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
APAF1O14727 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
APAF1O14727 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
APAF1O14727 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
APAF1O14727 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
APAF1O14727 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
APAF1O14727 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
APAF1O14727 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
APAF1O14727 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
APAF1O14727 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
APAF1O14727 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
APAF1O14727 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
APAF1O14727 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
APAF1O14727 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
APAF1O14727 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
APAF1O14727 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
APAF1O14727 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
APAF1O14727 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
APAF1O14727 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
APAF1O14727 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
APAF1O14727 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
APAF1O14727 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
APAF1O14727 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
APAF1O14727 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
APAF1O14727 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
APAF1O14727 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
APAF1O14727 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
APAF1O14727 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
APAF1O14727 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
APAF1O14727 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
APAF1O14727 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
APAF1O14727 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
APAF1O14727 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
APAF1O14727 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
APAF1O14727 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
APAF1O14727 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
APAF1O14727 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
APAF1O14727 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
APAF1O14727 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
APAF1O14727 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
APAF1O14727 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
APAF1O14727 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
APAF1O14727 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
APAF1O14727 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
APAF1O14727 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
APAF1O14727 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
APAF1O14727 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
APAF1O14727 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
APAF1O14727 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
APAF1O14727 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
APAF1O14727 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
APAF1O14727 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
APAF1O14727 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
APAF1O14727 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
APAF1O14727 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
APAF1O14727 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
APAF1O14727 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
APAF1O14727 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
APAF1O14727 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
APAF1O14727 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
APAF1O14727 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms