Protein–RNA interactions for Protein: O00451

GFRA2, GDNF family receptor alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA2O00451 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GFRA2O00451 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GFRA2O00451 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GFRA2O00451 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GFRA2O00451 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
GFRA2O00451 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GFRA2O00451 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
GFRA2O00451 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GFRA2O00451 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GFRA2O00451 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GFRA2O00451 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GFRA2O00451 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GFRA2O00451 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GFRA2O00451 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GFRA2O00451 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GFRA2O00451 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GFRA2O00451 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GFRA2O00451 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GFRA2O00451 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GFRA2O00451 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GFRA2O00451 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GFRA2O00451 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GFRA2O00451 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
GFRA2O00451 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GFRA2O00451 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GFRA2O00451 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GFRA2O00451 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GFRA2O00451 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GFRA2O00451 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GFRA2O00451 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GFRA2O00451 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
GFRA2O00451 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GFRA2O00451 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GFRA2O00451 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GFRA2O00451 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
GFRA2O00451 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GFRA2O00451 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GFRA2O00451 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GFRA2O00451 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GFRA2O00451 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GFRA2O00451 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GFRA2O00451 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GFRA2O00451 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GFRA2O00451 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GFRA2O00451 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GFRA2O00451 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GFRA2O00451 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GFRA2O00451 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GFRA2O00451 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GFRA2O00451 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GFRA2O00451 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GFRA2O00451 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GFRA2O00451 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GFRA2O00451 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GFRA2O00451 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GFRA2O00451 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GFRA2O00451 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GFRA2O00451 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GFRA2O00451 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GFRA2O00451 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GFRA2O00451 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GFRA2O00451 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GFRA2O00451 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GFRA2O00451 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GFRA2O00451 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GFRA2O00451 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GFRA2O00451 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GFRA2O00451 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
GFRA2O00451 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GFRA2O00451 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GFRA2O00451 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GFRA2O00451 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
GFRA2O00451 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GFRA2O00451 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GFRA2O00451 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GFRA2O00451 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GFRA2O00451 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GFRA2O00451 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GFRA2O00451 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GFRA2O00451 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GFRA2O00451 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GFRA2O00451 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GFRA2O00451 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GFRA2O00451 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GFRA2O00451 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GFRA2O00451 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GFRA2O00451 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GFRA2O00451 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GFRA2O00451 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GFRA2O00451 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GFRA2O00451 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GFRA2O00451 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GFRA2O00451 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GFRA2O00451 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GFRA2O00451 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GFRA2O00451 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GFRA2O00451 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GFRA2O00451 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GFRA2O00451 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GFRA2O00451 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms