Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ERVV-1B6SEH8 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ERVV-1B6SEH8 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ERVV-1B6SEH8 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ERVV-1B6SEH8 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
ERVV-1B6SEH8 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ERVV-1B6SEH8 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
ERVV-1B6SEH8 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ERVV-1B6SEH8 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ERVV-1B6SEH8 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ERVV-1B6SEH8 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ERVV-1B6SEH8 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ERVV-1B6SEH8 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ERVV-1B6SEH8 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ERVV-1B6SEH8 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ERVV-1B6SEH8 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ERVV-1B6SEH8 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ERVV-1B6SEH8 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ERVV-1B6SEH8 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ERVV-1B6SEH8 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ERVV-1B6SEH8 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ERVV-1B6SEH8 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ERVV-1B6SEH8 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
ERVV-1B6SEH8 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
ERVV-1B6SEH8 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ERVV-1B6SEH8 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ERVV-1B6SEH8 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ERVV-1B6SEH8 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ERVV-1B6SEH8 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ERVV-1B6SEH8 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ERVV-1B6SEH8 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ERVV-1B6SEH8 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
ERVV-1B6SEH8 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ERVV-1B6SEH8 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ERVV-1B6SEH8 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ERVV-1B6SEH8 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
ERVV-1B6SEH8 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ERVV-1B6SEH8 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ERVV-1B6SEH8 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
ERVV-1B6SEH8 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
ERVV-1B6SEH8 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ERVV-1B6SEH8 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ERVV-1B6SEH8 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ERVV-1B6SEH8 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ERVV-1B6SEH8 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ERVV-1B6SEH8 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ERVV-1B6SEH8 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ERVV-1B6SEH8 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ERVV-1B6SEH8 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ERVV-1B6SEH8 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ERVV-1B6SEH8 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ERVV-1B6SEH8 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ERVV-1B6SEH8 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ERVV-1B6SEH8 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ERVV-1B6SEH8 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ERVV-1B6SEH8 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ERVV-1B6SEH8 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
ERVV-1B6SEH8 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ERVV-1B6SEH8 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ERVV-1B6SEH8 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ERVV-1B6SEH8 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
ERVV-1B6SEH8 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ERVV-1B6SEH8 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
ERVV-1B6SEH8 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ERVV-1B6SEH8 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ERVV-1B6SEH8 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ERVV-1B6SEH8 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ERVV-1B6SEH8 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ERVV-1B6SEH8 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ERVV-1B6SEH8 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ERVV-1B6SEH8 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ERVV-1B6SEH8 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ERVV-1B6SEH8 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ERVV-1B6SEH8 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ERVV-1B6SEH8 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ERVV-1B6SEH8 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ERVV-1B6SEH8 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ERVV-1B6SEH8 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ERVV-1B6SEH8 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ERVV-1B6SEH8 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ERVV-1B6SEH8 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ERVV-1B6SEH8 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ERVV-1B6SEH8 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ERVV-1B6SEH8 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
ERVV-1B6SEH8 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ERVV-1B6SEH8 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ERVV-1B6SEH8 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ERVV-1B6SEH8 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ERVV-1B6SEH8 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ERVV-1B6SEH8 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ERVV-1B6SEH8 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
ERVV-1B6SEH8 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
ERVV-1B6SEH8 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
ERVV-1B6SEH8 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ERVV-1B6SEH8 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ERVV-1B6SEH8 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ERVV-1B6SEH8 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ERVV-1B6SEH8 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ERVV-1B6SEH8 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ERVV-1B6SEH8 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms