Protein–RNA interactions for Protein: A6NNM8

TTLL13P, Tubulin polyglutamylase TTLL13P, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL13PA6NNM8 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TTLL13PA6NNM8 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TTLL13PA6NNM8 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TTLL13PA6NNM8 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TTLL13PA6NNM8 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TTLL13PA6NNM8 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TTLL13PA6NNM8 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TTLL13PA6NNM8 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TTLL13PA6NNM8 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TTLL13PA6NNM8 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TTLL13PA6NNM8 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TTLL13PA6NNM8 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TTLL13PA6NNM8 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TTLL13PA6NNM8 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TTLL13PA6NNM8 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TTLL13PA6NNM8 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TTLL13PA6NNM8 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TTLL13PA6NNM8 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TTLL13PA6NNM8 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TTLL13PA6NNM8 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TTLL13PA6NNM8 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TTLL13PA6NNM8 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TTLL13PA6NNM8 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TTLL13PA6NNM8 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TTLL13PA6NNM8 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TTLL13PA6NNM8 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TTLL13PA6NNM8 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TTLL13PA6NNM8 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TTLL13PA6NNM8 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TTLL13PA6NNM8 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TTLL13PA6NNM8 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TTLL13PA6NNM8 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TTLL13PA6NNM8 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TTLL13PA6NNM8 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TTLL13PA6NNM8 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TTLL13PA6NNM8 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TTLL13PA6NNM8 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TTLL13PA6NNM8 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TTLL13PA6NNM8 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
TTLL13PA6NNM8 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TTLL13PA6NNM8 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TTLL13PA6NNM8 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TTLL13PA6NNM8 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TTLL13PA6NNM8 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TTLL13PA6NNM8 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TTLL13PA6NNM8 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TTLL13PA6NNM8 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TTLL13PA6NNM8 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TTLL13PA6NNM8 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TTLL13PA6NNM8 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TTLL13PA6NNM8 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TTLL13PA6NNM8 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TTLL13PA6NNM8 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TTLL13PA6NNM8 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TTLL13PA6NNM8 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TTLL13PA6NNM8 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TTLL13PA6NNM8 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TTLL13PA6NNM8 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TTLL13PA6NNM8 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TTLL13PA6NNM8 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TTLL13PA6NNM8 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TTLL13PA6NNM8 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TTLL13PA6NNM8 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TTLL13PA6NNM8 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TTLL13PA6NNM8 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TTLL13PA6NNM8 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TTLL13PA6NNM8 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TTLL13PA6NNM8 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TTLL13PA6NNM8 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TTLL13PA6NNM8 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TTLL13PA6NNM8 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TTLL13PA6NNM8 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TTLL13PA6NNM8 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TTLL13PA6NNM8 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TTLL13PA6NNM8 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TTLL13PA6NNM8 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TTLL13PA6NNM8 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TTLL13PA6NNM8 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TTLL13PA6NNM8 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TTLL13PA6NNM8 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TTLL13PA6NNM8 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TTLL13PA6NNM8 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TTLL13PA6NNM8 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TTLL13PA6NNM8 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TTLL13PA6NNM8 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TTLL13PA6NNM8 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TTLL13PA6NNM8 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TTLL13PA6NNM8 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TTLL13PA6NNM8 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TTLL13PA6NNM8 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TTLL13PA6NNM8 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TTLL13PA6NNM8 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TTLL13PA6NNM8 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TTLL13PA6NNM8 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TTLL13PA6NNM8 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TTLL13PA6NNM8 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TTLL13PA6NNM8 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TTLL13PA6NNM8 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TTLL13PA6NNM8 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TTLL13PA6NNM8 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms