Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YYL6

RPL17-C18orf32, Protein RPL17-C18orf32, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms