Protein–RNA interactions for Protein: Q9P232

CNTN3, Contactin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,028 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN3Q9P232 AC114550.3-201ENST00000524073 579 ntTSL 4 BASIC7.4□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 AP000662.1-201ENST00000530952 487 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 AP006587.5-201ENST00000532033 739 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 AC006065.4-204ENST00000537478 654 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 AC006065.4-203ENST00000541065 526 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 AC009269.4-201ENST00000557828 440 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 LINC01491-202ENST00000558792 439 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 CNEP1R1-204ENST00000562576 656 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 AC008551.1-201ENST00000575612 405 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 LINC01899-203ENST00000584810 337 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 AC005244.2-201ENST00000585228 718 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 AC006305.3-201ENST00000590589 454 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 AC113137.1-201ENST00000591869 558 ntTSL 4 BASIC7.4□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 AL353593.3-201ENST00000602778 764 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 AC009237.13-201ENST00000603193 276 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 AC009220.3-201ENST00000604318 586 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 AC009237.12-201ENST00000604755 742 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 AL590032.1-201ENST00000604920 252 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 AC018714.1-201ENST00000605028 208 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 AP002360.3-201ENST00000607673 710 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 AC026951.2-201ENST00000613847 241 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 HTR1DP1-201ENST00000616500 888 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 AC025287.2-201ENST00000621911 668 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 AC022140.2-201ENST00000623500 188 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 AC244517.7-201ENST00000625144 398 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 SNORA16A-202ENST00000628458 135 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 SEPT14P19-203ENST00000633205 211 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 PCMTD1P7-201ENST00000634506 357 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 AC087821.2-201ENST00000637086 450 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 GCNT2-218ENST00000640968 939 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 MTND4P31-201ENST00000425607 1343 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 LYSMD3-201ENST00000315948 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 FCGR1B-210ENST00000623603 1581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 GOLGB1-201ENST00000340645 11187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 PGK2-201ENST00000304801 1657 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.23
CNTN3Q9P232 AC021205.3-201ENST00000609680 1709 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.23
CNTN3Q9P232 UEVLD-202ENST00000320750 1799 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
CNTN3Q9P232 HEPACAM2-201ENST00000341723 2122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
CNTN3Q9P232 VN1R1-201ENST00000321039 2353 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.23
CNTN3Q9P232 AC104162.1-201ENST00000430831 2382 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
CNTN3Q9P232 RALYL-204ENST00000518566 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.23
CNTN3Q9P232 NCAPH-205ENST00000455200 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
CNTN3Q9P232 ATOX1-203ENST00000521264 4341 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.23
CNTN3Q9P232 AC087477.2-202ENST00000558499 4856 ntTSL 4 BASIC7.39□□□□□ -1.23
CNTN3Q9P232 PTK2-228ENST00000521059 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
CNTN3Q9P232 AP2B1-215ENST00000616681 3267 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
CNTN3Q9P232 SHC4-202ENST00000396535 2799 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
CNTN3Q9P232 TPRG1-204ENST00000433971 2296 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
CNTN3Q9P232 ALS2-201ENST00000264276 6644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
CNTN3Q9P232 NARS2-204ENST00000528850 2137 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
CNTN3Q9P232 PKIA-AS1-202ENST00000522302 2011 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
CNTN3Q9P232 TRAT1-201ENST00000295756 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
CNTN3Q9P232 LRRC37A12P-201ENST00000454917 1801 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
CNTN3Q9P232 AP002004.1-203ENST00000531091 1768 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
CNTN3Q9P232 AC078880.4-201ENST00000617627 1749 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
CNTN3Q9P232 CENPN-203ENST00000393335 1556 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
CNTN3Q9P232 ROR1-AS1-201ENST00000412349 1574 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
CNTN3Q9P232 LIPF-203ENST00000394375 1470 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
CNTN3Q9P232 AL031651.1-201ENST00000615357 1438 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
CNTN3Q9P232 NEUROD4-201ENST00000242994 3953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
CNTN3Q9P232 RPL39P5-201ENST00000273411 449 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
CNTN3Q9P232 OR4F17-201ENST00000318050 1054 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
CNTN3Q9P232 ASB4-202ENST00000325885 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
CNTN3Q9P232 RNU6-500P-201ENST00000362349 107 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
CNTN3Q9P232 TUBD1-204ENST00000376094 1154 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
CNTN3Q9P232 MIR142-201ENST00000384835 87 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
CNTN3Q9P232 AC008440.2-201ENST00000413496 423 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
CNTN3Q9P232 CEACAMP8-201ENST00000413902 580 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
CNTN3Q9P232 AL035604.1-201ENST00000416481 531 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
CNTN3Q9P232 AL513325.1-201ENST00000417716 1034 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
CNTN3Q9P232 AC005009.1-201ENST00000423979 269 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
CNTN3Q9P232 IPMKP1-201ENST00000425988 855 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
CNTN3Q9P232 DSTNP5-201ENST00000427921 523 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
CNTN3Q9P232 AL590128.1-201ENST00000433407 286 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
CNTN3Q9P232 LINC01680-201ENST00000434983 299 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
CNTN3Q9P232 MIR4432HG-201ENST00000441598 470 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
CNTN3Q9P232 MLIP-IT1-201ENST00000441845 643 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
CNTN3Q9P232 NFIA-AS1-201ENST00000442027 384 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
CNTN3Q9P232 AC004470.1-201ENST00000442155 382 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
CNTN3Q9P232 IGKV1OR10-1-201ENST00000442306 329 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
CNTN3Q9P232 AL137845.2-201ENST00000444292 988 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
CNTN3Q9P232 USP9YP29-201ENST00000445112 563 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
CNTN3Q9P232 LINC01828-201ENST00000445514 531 ntTSL 4 BASIC7.39□□□□□ -1.23
CNTN3Q9P232 SEPHS1P4-201ENST00000446112 1176 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
CNTN3Q9P232 ZNF619P1-201ENST00000446539 752 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
CNTN3Q9P232 VN1R34P-201ENST00000447387 883 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
CNTN3Q9P232 RPL23AP28-201ENST00000448062 470 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
CNTN3Q9P232 CD200R1L-202ENST00000448932 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
CNTN3Q9P232 MIR4432HG-202ENST00000453476 703 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
CNTN3Q9P232 AC010884.1-201ENST00000456519 642 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
CNTN3Q9P232 IGKV1OR22-5-201ENST00000458718 354 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
CNTN3Q9P232 AP003385.3-201ENST00000472498 287 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
CNTN3Q9P232 RN7SL187P-201ENST00000495587 303 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
CNTN3Q9P232 LINC02271-202ENST00000506379 596 ntTSL 4 BASIC7.39□□□□□ -1.23
CNTN3Q9P232 SNX18P23-201ENST00000510867 677 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
CNTN3Q9P232 AC010587.2-201ENST00000511727 448 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
CNTN3Q9P232 FABP5P5-201ENST00000515537 406 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
CNTN3Q9P232 AC108449.1-202ENST00000517632 478 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
CNTN3Q9P232 AC245519.1-201ENST00000522799 512 ntTSL 4 BASIC7.39□□□□□ -1.23
CNTN3Q9P232 BAALC-AS1-208ENST00000523614 582 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.1 ms