Protein–RNA interactions for Protein: Q92854

SEMA4D, Semaphorin-4D, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4DQ92854 ESRRG-224ENST00000616180 5194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
SEMA4DQ92854 SRGAP1-201ENST00000355086 23331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
SEMA4DQ92854 ZNF402P-201ENST00000404435 3100 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
SEMA4DQ92854 PFKFB2-201ENST00000367079 3494 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
SEMA4DQ92854 CHMP1B2P-202ENST00000614414 6813 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
SEMA4DQ92854 ARHGEF3-203ENST00000413728 3992 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
SEMA4DQ92854 MPP5-204ENST00000555925 5006 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
SEMA4DQ92854 KCNJ1-204ENST00000392665 4074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
SEMA4DQ92854 AC099811.1-201ENST00000597755 1496 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SEMA4DQ92854 AC100757.1-201ENST00000616872 1835 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SEMA4DQ92854 KIAA1328-201ENST00000280020 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
SEMA4DQ92854 GPATCH11-201ENST00000281932 3570 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
SEMA4DQ92854 STMN2-201ENST00000220876 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
SEMA4DQ92854 CCR2-202ENST00000400888 2232 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
SEMA4DQ92854 OTUD4-202ENST00000454497 7069 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SEMA4DQ92854 C3orf67-209ENST00000482387 2617 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SEMA4DQ92854 AL132656.3-201ENST00000606384 1595 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SEMA4DQ92854 MBNL2-204ENST00000397601 4487 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SEMA4DQ92854 TSPAN6-204ENST00000612152 3796 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SEMA4DQ92854 ATF2-201ENST00000264110 4176 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
SEMA4DQ92854 GPR52-201ENST00000367685 1088 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SEMA4DQ92854 SSX1-201ENST00000376919 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
SEMA4DQ92854 RNU11-201ENST00000387069 134 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SEMA4DQ92854 PPIAP9-201ENST00000403866 498 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SEMA4DQ92854 AL807757.1-201ENST00000437846 424 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SEMA4DQ92854 LINC01133-202ENST00000443364 1266 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SEMA4DQ92854 AC007655.1-201ENST00000444324 357 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SEMA4DQ92854 RPL35AP19-201ENST00000469425 329 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SEMA4DQ92854 RGS1-203ENST00000469578 1034 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SEMA4DQ92854 TFDP2-211ENST00000479040 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
SEMA4DQ92854 MORF4L2P1-201ENST00000503761 858 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SEMA4DQ92854 AC012629.1-201ENST00000503953 342 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SEMA4DQ92854 TMEM97P2-201ENST00000517841 403 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SEMA4DQ92854 AC009623.1-201ENST00000517964 1131 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SEMA4DQ92854 AC025370.1-201ENST00000523775 583 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SEMA4DQ92854 AP003086.3-201ENST00000527030 365 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SEMA4DQ92854 TRDV3-201ENST00000535880 425 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SEMA4DQ92854 ETFRF1-211ENST00000557540 1259 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SEMA4DQ92854 PSMA4-209ENST00000559082 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SEMA4DQ92854 AC106729.1-201ENST00000567777 466 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SEMA4DQ92854 SNORD95-201ENST00000579879 68 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SEMA4DQ92854 SMIM24-204ENST00000591708 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SEMA4DQ92854 LINC01198-207ENST00000598084 881 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SEMA4DQ92854 AL360012.1-201ENST00000602813 131 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SEMA4DQ92854 XIST-210ENST00000602863 775 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SEMA4DQ92854 AL160400.1-201ENST00000606385 1030 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
SEMA4DQ92854 AL391597.1-201ENST00000618707 694 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SEMA4DQ92854 HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 337 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SEMA4DQ92854 AC021766.1-201ENST00000624404 741 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SEMA4DQ92854 AC068631.1-223ENST00000625877 472 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SEMA4DQ92854 CFTRP2-201ENST00000634304 199 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SEMA4DQ92854 OR6C75-202ENST00000641576 4569 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SEMA4DQ92854 MAP9-208ENST00000515654 2044 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
SEMA4DQ92854 RAPGEF4-213ENST00000535187 3707 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
SEMA4DQ92854 ZNF492-201ENST00000456783 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
SEMA4DQ92854 LINC01152-201ENST00000472655 3578 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
SEMA4DQ92854 AC120036.2-201ENST00000509729 1474 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
SEMA4DQ92854 FIGN-201ENST00000333129 9536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
SEMA4DQ92854 AC003973.3-201ENST00000624863 2822 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SEMA4DQ92854 EPPIN-202ENST00000354280 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
SEMA4DQ92854 ACE2-201ENST00000252519 3393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
SEMA4DQ92854 AC087473.1-201ENST00000561320 2471 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
SEMA4DQ92854 CASC19-260ENST00000641828 2001 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SEMA4DQ92854 OR10G7-202ENST00000641585 3449 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SEMA4DQ92854 ABI2-204ENST00000295851 22209 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
SEMA4DQ92854 NXPE4-202ENST00000424261 1687 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
SEMA4DQ92854 F9-201ENST00000218099 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
SEMA4DQ92854 KARSP1-201ENST00000451871 1752 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SEMA4DQ92854 RNU4-2-201ENST00000365668 141 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SEMA4DQ92854 AL389925.1-201ENST00000432257 728 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SEMA4DQ92854 LINC02094-201ENST00000437646 520 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
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SEMA4DQ92854 SETP20-201ENST00000457046 852 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
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SEMA4DQ92854 SCARNA20.4-201ENST00000516969 131 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SEMA4DQ92854 AC097173.2-201ENST00000518701 474 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SEMA4DQ92854 YWHAZ-220ENST00000522819 875 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SEMA4DQ92854 AP002370.2-202ENST00000533669 908 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
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SEMA4DQ92854 AC005670.2-201ENST00000571841 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
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SEMA4DQ92854 OOSP1P2-201ENST00000579644 351 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SEMA4DQ92854 AC009303.3-201ENST00000591103 736 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SEMA4DQ92854 AC087468.1-201ENST00000604365 630 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SEMA4DQ92854 AC010632.3-201ENST00000611377 369 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SEMA4DQ92854 AC007786.3-201ENST00000615154 596 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SEMA4DQ92854 LINC01320-210ENST00000626008 929 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SEMA4DQ92854 LARP4-203ENST00000398473 6427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
SEMA4DQ92854 EEF1A1P30-201ENST00000429708 1315 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SEMA4DQ92854 AC140134.1-201ENST00000511830 3544 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SEMA4DQ92854 AL137141.1-201ENST00000624622 4836 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SEMA4DQ92854 FOXN2-203ENST00000616844 1414 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SEMA4DQ92854 TET1-201ENST00000373644 9288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
SEMA4DQ92854 AP002512.4-202ENST00000641599 4530 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SEMA4DQ92854 MAP3K7-203ENST00000369327 4558 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
SEMA4DQ92854 TRPC4-202ENST00000355779 2784 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
SEMA4DQ92854 TRPC4-204ENST00000379673 2760 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
SEMA4DQ92854 ZNF337-AS1-201ENST00000414393 4666 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SEMA4DQ92854 MDN1-201ENST00000369393 18413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
SEMA4DQ92854 AKAP6-212ENST00000557272 4601 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
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