Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 AC007346.2-201ENST00000564816 892 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 AC126323.4-201ENST00000566935 234 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 MIR744-201ENST00000578242 98 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 RN7SL131P-201ENST00000579043 256 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 AC005208.1-202ENST00000587325 725 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 ZNF43-209ENST00000598288 560 ntTSL 4 BASIC6.99□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 AC022145.1-201ENST00000600673 383 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 AL035411.2-201ENST00000604022 421 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 AC097467.3-215ENST00000609486 793 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 AC097467.3-214ENST00000610249 843 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 AC009237.15-201ENST00000610252 501 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 AC011330.2-201ENST00000621680 635 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 JAKMIP2-AS1-202ENST00000627433 831 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 MDN1-201ENST00000369393 18413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 SHQ1P1-201ENST00000437111 1544 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 SGO2-201ENST00000357799 4214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 PTPRT-201ENST00000356100 12480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 PTPRT-202ENST00000373184 12483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 PTPRT-203ENST00000373187 12453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 TERB1-203ENST00000558713 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 LRRC37A3-204ENST00000400877 3273 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 RNF133-201ENST00000340112 1445 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 TRRAP-204ENST00000446306 12492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 KIF2A-203ENST00000407818 2315 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 AL353784.1-201ENST00000422842 2300 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 LINC01822-201ENST00000435682 2098 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 SSXP3-201ENST00000442971 1300 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 SERPINB7-202ENST00000398019 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 TRMT13-202ENST00000370141 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 STK3-216ENST00000523601 3107 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 RRH-201ENST00000317735 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 ERVH48-1-201ENST00000447535 2790 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 PDE4B-203ENST00000371045 3982 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 LRRC37B-204ENST00000543378 3091 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 MTND4P10-201ENST00000446199 1363 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 DCAF8L1-201ENST00000441525 3457 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 CEP128-202ENST00000281129 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 CABYR-207ENST00000486759 1664 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 HTN1-201ENST00000246896 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 OR5A1-201ENST00000302030 1051 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 MIR138-2-201ENST00000384916 84 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 RNU11-201ENST00000387069 134 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 LIX1L-AS1-202ENST00000412239 570 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 AL157698.1-201ENST00000415190 1011 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 Z75741.2-201ENST00000417272 1167 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 AL158166.2-201ENST00000420845 748 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 AL513175.2-201ENST00000422071 443 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 AP001324.1-201ENST00000428553 399 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 LINC01762-205ENST00000437308 539 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 AL451164.3-201ENST00000441377 447 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 DBIL5P2-201ENST00000443827 253 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 AF196972.1-201ENST00000445586 653 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 AC112492.1-201ENST00000449607 712 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 RHEBP2-201ENST00000450289 600 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 AC005229.2-201ENST00000456995 399 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 BX323845.2-201ENST00000458382 234 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 AC005410.1-202ENST00000460347 485 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 CBX5P1-201ENST00000468470 561 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 AC004815.1-201ENST00000484185 331 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 LINC02049-201ENST00000490647 747 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 AC010273.1-201ENST00000504129 946 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 AC084871.1-201ENST00000508020 628 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 NACAP6-201ENST00000509572 622 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 AC017007.1-201ENST00000511960 415 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 IGJP1-201ENST00000522682 475 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 AC087623.1-201ENST00000533301 377 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 AC007688.2-201ENST00000545158 369 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 AC090971.3-201ENST00000557871 1041 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 AC011120.1-201ENST00000583916 624 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 AL512605.1-201ENST00000588215 1263 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 AC011921.2-201ENST00000589465 152 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 SIGLECL1-205ENST00000597824 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 AL360012.1-201ENST00000602813 131 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 AL157899.1-201ENST00000604110 936 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 AL445423.1-201ENST00000609941 536 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 AL031777.2-201ENST00000611953 196 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 AL138478.1-201ENST00000612252 832 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 FP325318.1-201ENST00000616097 1263 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 AC013470.4-201ENST00000619978 986 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 ZRANB2-AS2-220ENST00000623721 1133 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 AC074387.1-201ENST00000632044 823 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 OR6C3-203ENST00000641740 1093 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 UGGT1-201ENST00000259253 10650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 FRMD3-207ENST00000621208 5064 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 LINC01224-203ENST00000596283 2766 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 BRIP1-201ENST00000259008 6048 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 RABL3-201ENST00000273375 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 AC021086.1-201ENST00000499025 1569 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 TTTY4B-201ENST00000420149 1346 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 TTTY4-201ENST00000436568 1346 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 TTTY4C-201ENST00000456123 1346 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 AC004656.1-201ENST00000568479 4951 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 FRMD7-202ENST00000370879 2864 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 PIK3C2A-201ENST00000265970 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 CDC42BPA-201ENST00000334218 10134 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 AC009313.2-201ENST00000417893 1941 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 BLM-201ENST00000355112 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 NFE2L2-204ENST00000423513 1382 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 CARF-212ENST00000434998 1955 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 TC2N-202ENST00000360594 3751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.6 ms