Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 AC005692.2-201ENST00000566521 596 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 AC113418.1-201ENST00000569928 517 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 AC022098.3-201ENST00000590715 315 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 AC012616.1-201ENST00000600294 197 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 SUGT1P3-202ENST00000604259 383 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 AC010245.2-201ENST00000606908 1167 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 PACRG-210ENST00000611387 279 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 Xist_exon4.1-201ENST00000615964 126 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 AL118522.2-201ENST00000616045 615 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 AC008115.4-201ENST00000619780 775 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 MIR6730-201ENST00000622213 67 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 AC132068.1-201ENST00000623805 459 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 NEK3-211ENST00000629912 141 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 CASC19-264ENST00000641912 1184 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 PTPRT-201ENST00000356100 12480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 PTPRT-202ENST00000373184 12483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 PTPRT-203ENST00000373187 12453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 NBPF26-202ENST00000611287 2701 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 NBPF14-211ENST00000621070 2701 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 CDY11P-201ENST00000447168 1651 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 AL606516.1-201ENST00000455438 1861 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 TYW3-203ENST00000457880 3335 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 ECT2L-203ENST00000423192 4319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 MTHFD2L-207ENST00000433372 1407 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 NCOA4P2-201ENST00000340589 1813 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 ZSCAN4-201ENST00000318203 2246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 TGIF1-208ENST00000472042 2214 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 DIAPH3-208ENST00000498416 2249 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 AC087516.1-201ENST00000561236 2428 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 CFAP57-204ENST00000528956 3037 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 SLC4A10-202ENST00000375514 5710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 SLC12A1-201ENST00000330289 1764 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 MT-RNR2-201ENST00000387347 1559 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 ZNF268-205ENST00000536435 13475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 ZNF311-203ENST00000377179 2730 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 GRID2-204ENST00000510992 2739 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 LDAH-211ENST00000541941 3807 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 TRIM51-201ENST00000244891 1329 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 AC007159.1-201ENST00000566529 4706 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 OR9Q2-202ENST00000641291 3774 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 YTHDC1-207ENST00000579690 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 DDX58-201ENST00000379868 4089 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 MKI67-201ENST00000368653 11417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 AL132656.2-201ENST00000482985 1837 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 SPRR2D-201ENST00000360379 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 RNA5SP234-201ENST00000363916 119 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 RN7SKP6-201ENST00000364795 319 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 SNORA70-201ENST00000384436 135 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 NT5C3A-206ENST00000409787 840 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 RN7SKP17-201ENST00000411242 351 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 MIR3681HG-202ENST00000412606 578 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 AL020994.2-201ENST00000413244 571 ntTSL 4 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 RPSAP35-201ENST00000413753 818 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 AL122019.1-201ENST00000438575 798 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 PTMAP6-201ENST00000439110 327 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 LINC01359-203ENST00000444349 381 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 AL590764.1-201ENST00000450860 726 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 RN7SL51P-201ENST00000468230 285 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 RPS4XP1-201ENST00000482189 787 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 PTPN20-212ENST00000502254 599 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 AC106864.2-201ENST00000505632 740 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 AC006499.3-201ENST00000506077 748 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 AC107391.1-201ENST00000514966 412 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 OR5AM1P-201ENST00000532136 1032 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 OR10G5P-201ENST00000532733 358 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 TRDV3-201ENST00000535880 425 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 AC084824.2-201ENST00000548906 345 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 AL161752.1-201ENST00000557721 263 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 AC079414.1-201ENST00000563114 488 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 AC092132.1-201ENST00000570859 352 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 AC010761.5-201ENST00000579468 287 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 AC090457.1-201ENST00000579775 211 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 H3F3BP2-201ENST00000583907 357 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 AL353729.2-201ENST00000605859 1249 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 AL352984.2-202ENST00000613699 155 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 AC022960.2-201ENST00000616300 666 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 MIR6837-201ENST00000620884 64 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 ZNF93-209ENST00000638737 1020 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 RUVBL2-214ENST00000640699 153 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 RALGAPA1-202ENST00000382366 6328 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 FBXW12-201ENST00000296438 1647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 ZNF521-201ENST00000361524 4871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 LINC01553-203ENST00000521074 4329 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 RNF20-202ENST00000389120 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 ESRRG-219ENST00000487276 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 AHNAK2-201ENST00000333244 18254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 FABP2-201ENST00000274024 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 AC004076.2-201ENST00000620532 3323 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 C1orf140-202ENST00000439004 4340 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 DLGAP1-AS2-202ENST00000573177 1388 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 ART3-202ENST00000349321 1528 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 AC053481.2-202ENST00000582394 1500 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 ZEB1-219ENST00000560721 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 SDAD1-203ENST00000395711 2513 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 UGT2A1-205ENST00000512704 2519 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 EPHA4-202ENST00000409854 3454 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 AL603840.1-201ENST00000422374 4063 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 HHLA2-209ENST00000489514 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 ALG11-202ENST00000521508 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 ECT2L-205ENST00000541398 4483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
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