Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 AL355075.2-201ENST00000555435 478 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 AC048382.2-201ENST00000560239 492 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 AL390726.5-202ENST00000564800 256 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 DPRXP4-201ENST00000578053 568 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 MIR4310-201ENST00000582950 57 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 SSX9-202ENST00000608568 580 ntTSL 4 BASIC6.18□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 AL442125.2-201ENST00000619338 418 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 SERPINB10-204ENST00000619595 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 OR52B4-201ENST00000624801 1124 ntAPPRIS P1 BASIC6.18□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 AC022919.1-201ENST00000624979 626 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 AL731566.1-201ENST00000620490 1937 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 DYNC1I2-201ENST00000340296 2589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 AC000374.1-201ENST00000434698 1745 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 ZBTB38-220ENST00000514251 7683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 AC048341.2-201ENST00000550290 8693 ntTSL 4 BASIC6.18□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 OR4F13P-202ENST00000560066 2054 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 PROM1-220ENST00000540805 3908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 TOPBP1-201ENST00000260810 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 ADH4-207ENST00000505590 1400 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 LRRC19-201ENST00000380055 3609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 ZEB1-201ENST00000320985 5423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 C3orf67-AS1-202ENST00000482372 2203 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 PTPRO-210ENST00000544244 3978 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 ADGRL2-206ENST00000370721 5023 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 BPY2-201ENST00000331070 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 AL159987.1-201ENST00000347911 293 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 ZRSR2-202ENST00000380308 744 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 BPY2C-201ENST00000382287 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 BPY2B-201ENST00000382392 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 TRAV35-201ENST00000390462 330 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 AC092811.1-201ENST00000428642 397 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 MIS18A-AS1-201ENST00000453549 769 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 RPL32P33-201ENST00000487023 394 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 SPINK13-202ENST00000511106 661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 AC011405.1-204ENST00000512875 731 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 AP006245.2-201ENST00000522004 300 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 HNF1A-AS1-203ENST00000537361 659 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 LRTOMT-215ENST00000538478 814 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 AC136944.1-201ENST00000567464 560 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 AC074050.3-201ENST00000569175 441 ntTSL 4 BASIC6.17□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 MTCYBP13-201ENST00000578634 1093 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 AC010320.2-201ENST00000593857 551 ntTSL 4 BASIC6.17□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 ZNF66-203ENST00000594534 757 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 PACRG-210ENST00000611387 279 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 MIR7109-201ENST00000613748 65 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 MILR1-203ENST00000615220 1196 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 NKAIN2-204ENST00000545433 3052 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 EXO1-201ENST00000348581 3192 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 C11orf54-206ENST00000528099 1862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 ARHGAP21-202ENST00000376410 3526 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 ESRRG-202ENST00000360012 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 SDHC-202ENST00000367975 13566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 STK31-201ENST00000354639 3596 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 AL731532.2-201ENST00000623542 1953 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 KCNT2-203ENST00000451324 3146 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 ADGRL3-217ENST00000514591 6297 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 ERP27-201ENST00000266397 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 PRUNE2-207ENST00000428286 12437 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 Z94721.2-201ENST00000609590 5310 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 WDR17-201ENST00000280190 4705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 OTC-201ENST00000039007 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 OR8A1-203ENST00000641670 5709 ntAPPRIS P1 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 OR56A3-201ENST00000329564 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 TMSB4XP2-201ENST00000335179 210 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 ODF3-202ENST00000342593 386 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 OR2J2-202ENST00000377167 1272 ntAPPRIS P1 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 SETP15-201ENST00000412724 337 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 CBX1P3-201ENST00000413296 527 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 AC004882.2-201ENST00000420180 244 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 SDCBP-203ENST00000424270 1277 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 HSPD1P12-201ENST00000429127 1069 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 CA1-201ENST00000431316 1232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 AC211433.1-202ENST00000434256 1187 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 C1orf140-201ENST00000434398 645 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 PCBP2P1-201ENST00000437262 977 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 AMYP1-201ENST00000440059 1023 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 AF064858.2-201ENST00000440714 292 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 AL358876.1-201ENST00000453364 1075 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 BBIP1-208ENST00000454061 812 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 ZIC4-AS1-201ENST00000462168 268 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 AC104339.1-201ENST00000465478 348 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 RN7SL570P-201ENST00000484405 292 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 AC091544.1-201ENST00000484702 348 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 MYL12BP2-201ENST00000503948 512 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 RN7SKP253-201ENST00000516424 309 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 AC124067.3-201ENST00000522643 847 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 LINC01033-204ENST00000523194 715 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 AL133481.2-201ENST00000538322 367 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 AC122688.1-201ENST00000541494 223 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 AC007569.1-202ENST00000547282 303 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 CYCSP38-201ENST00000559840 322 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 POU1F1-203ENST00000560656 647 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 LINC02563-201ENST00000579474 277 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 SP2-AS1-204ENST00000585280 405 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 ZNF528-211ENST00000598192 625 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 Z98949.1-207ENST00000609157 814 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 AL683826.1-201ENST00000624104 627 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 AC073592.6-201ENST00000624271 415 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 AC005972.4-201ENST00000636248 1131 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 AC099654.6-201ENST00000636487 512 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
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