Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 BAZ2B-203ENST00000392782 8058 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 ZNF780A-204ENST00000455521 3600 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 OR51J1-201ENST00000332043 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 RNA5SP273-201ENST00000362484 113 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 LINC00474-201ENST00000374014 769 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 AC017019.1-201ENST00000426129 261 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 AC110602.1-201ENST00000437414 318 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 AL021937.3-201ENST00000446543 361 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 AL358876.1-201ENST00000453364 1075 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 CTSLP6-201ENST00000458273 1002 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 RN7SL170P-201ENST00000487098 295 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 AC069304.1-201ENST00000491593 704 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 MYL12BP2-201ENST00000503948 512 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 AC011405.1-204ENST00000512875 731 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 EIF3KP3-201ENST00000514461 639 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 AC097537.1-201ENST00000514864 1213 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 SCARNA18.1-201ENST00000516330 83 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 WDYHV1-203ENST00000518125 880 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 AC027369.2-201ENST00000528030 440 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 AC027369.5-201ENST00000533838 755 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 AC006530.1-201ENST00000555980 571 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 AL161752.1-201ENST00000557721 263 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 PRPF19P1-201ENST00000584766 898 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 AC092070.2-201ENST00000597550 545 ntTSL 4 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 AC006363.1-201ENST00000603806 463 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 MIR6793-201ENST00000612376 63 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 ZNF253-205ENST00000640599 1208 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 PMS2-203ENST00000382321 1386 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 ENSA-214ENST00000513281 1369 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 MLH3-210ENST00000556257 4229 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 ZNF415-203ENST00000500065 2496 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 USP28-213ENST00000544967 3498 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 LINC00504-201ENST00000505089 4672 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 DCLK1-204ENST00000379893 4612 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 DDHD2-202ENST00000517385 4113 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 SRSF11-201ENST00000370949 3034 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 ZBED6-202ENST00000550078 12481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 OR2J3-202ENST00000641151 3297 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 ZFP14-201ENST00000270001 7489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 SLC15A2-201ENST00000295605 2379 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 POF1B-201ENST00000262753 3941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 SLC12A1-205ENST00000558405 3426 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 ADGRL2-206ENST00000370721 5023 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 RRP15-201ENST00000366932 7771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 AC007618.1-201ENST00000366455 732 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 RPL21P67-201ENST00000402896 478 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 AL121878.1-201ENST00000418638 859 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 BX284632.2-201ENST00000421091 399 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 IL23R-203ENST00000425614 1295 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 OR5K2-201ENST00000427338 1060 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 CA1-201ENST00000431316 1232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 AC069154.1-201ENST00000432914 542 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
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CUL1Q13616 AF064858.2-201ENST00000440714 292 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 AL512605.1-202ENST00000441919 381 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 AL359955.2-201ENST00000445380 353 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 PPIA-203ENST00000451562 544 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 AL021940.1-201ENST00000454271 677 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 ARPP21-231ENST00000474696 572 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 IGBP1P4-201ENST00000503202 879 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 DUTP7-201ENST00000507982 486 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 AC107396.1-201ENST00000509641 735 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 CENPK-210ENST00000510354 1124 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 IMPA1P1-201ENST00000510718 842 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 AC114781.3-201ENST00000512083 142 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 Y_RNA.667-201ENST00000516212 107 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 RNA5SP438-201ENST00000516561 112 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 AC064802.1-201ENST00000521523 866 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 GPRC5D-AS1-203ENST00000536029 466 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 AC007066.2-202ENST00000566531 914 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 AC046158.2-201ENST00000568764 707 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 ZNF528-211ENST00000598192 625 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
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CUL1Q13616 AL442125.2-201ENST00000619338 418 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 AC073593.1-201ENST00000624500 411 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 SAMMSON-227ENST00000642114 1199 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 ZNF143-201ENST00000299606 2562 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 MTERF1-203ENST00000419292 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 PRPF4B-201ENST00000337659 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 ABI1-210ENST00000376170 3362 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 B3GALT2-201ENST00000367434 3274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 OR4F5-202ENST00000641515 2618 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 FOXN2-203ENST00000616844 1414 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 DCN-202ENST00000393155 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 AL031595.2-201ENST00000624215 19071 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 MT-RNR2-201ENST00000387347 1559 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 STON1-201ENST00000404752 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 ATF2-201ENST00000264110 4176 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 CYLD-207ENST00000564326 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 ZNF283-201ENST00000324461 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 SMNDC1-202ENST00000369603 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 MFAP1-201ENST00000267812 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 SLC10A7-202ENST00000394059 1730 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 CLIP1-AS1-201ENST00000535976 1745 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 OR9K1P-202ENST00000641111 3217 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 OR1L4-201ENST00000259466 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 GLYAT-201ENST00000278400 1150 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 C3orf49-201ENST00000295896 1292 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 BPY2-201ENST00000331070 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 AL159987.1-201ENST00000347911 293 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
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