Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 AC008883.2-201ENST00000505796 414 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 AC083902.1-201ENST00000508578 359 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 AC008415.1-201ENST00000522189 734 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 AC091185.1-201ENST00000523840 528 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 AP003122.4-201ENST00000530980 758 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 SNHG1-212ENST00000539975 955 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 AL358292.1-201ENST00000554181 412 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 AC009097.1-201ENST00000567077 406 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 AC138915.2-201ENST00000569776 97 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 AC116003.1-202ENST00000579386 501 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 RN7SL473P-201ENST00000580341 299 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 AC022031.2-203ENST00000587346 565 ntTSL 4 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 VDAC1P8-204ENST00000589489 997 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 MIR7515HG-250ENST00000592565 856 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 AC007687.1-201ENST00000602704 304 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 AL162413.1-201ENST00000603198 110 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 AC108451.2-201ENST00000603875 538 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 AC000068.3-201ENST00000607934 427 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 AC006335.3-201ENST00000613408 292 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 AC040896.1-201ENST00000613819 479 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 MALAT1-209ENST00000616691 587 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 Metazoa_SRP.108-201ENST00000621610 300 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 AL138693.1-201ENST00000622219 129 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 LINC01440-208ENST00000627300 699 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 AL160396.1-201ENST00000637433 575 ntTSL 4 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 PAX8-AS1-201ENST00000333145 2319 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 MATR3-203ENST00000502499 2664 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 SCIN-201ENST00000297029 9713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 OR2A5-202ENST00000641693 8681 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 KIF1B-201ENST00000263934 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 CASR-205ENST00000639785 10047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 GART-201ENST00000361093 2149 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 NASP-224ENST00000537798 3097 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 C1orf131-203ENST00000366651 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 TRAPPC13-204ENST00000438419 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 AC021242.1-201ENST00000507315 2035 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 ZNF19-201ENST00000288177 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 CDKAL1-204ENST00000613575 1673 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 NEK10-201ENST00000295720 2871 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 PLEKHM3-202ENST00000427836 9807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 SLC15A1-202ENST00000376503 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 CCR9-204ENST00000422395 1331 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 AMOT-201ENST00000304758 6888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 DIS3-201ENST00000377767 10604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 TMEM75-201ENST00000624314 2165 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 AC008080.4-201ENST00000420185 1589 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 UBQLN3-201ENST00000311659 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 RRM2-201ENST00000304567 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 CTNND1-234ENST00000532844 6012 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 CCDC66-203ENST00000394672 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 ZNF682-207ENST00000595736 1710 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 AL138756.1-201ENST00000563434 4488 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 EEF1A1P5-201ENST00000436459 1389 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 TNFRSF19-204ENST00000403372 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 C1orf158-203ENST00000614859 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 CPA4-201ENST00000222482 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 C11orf63-203ENST00000531316 2782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 PPARA-201ENST00000262735 9965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 HRG-201ENST00000232003 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 HLTF-203ENST00000465259 5306 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 PIP-201ENST00000291009 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 RNU6-462P-201ENST00000362659 105 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 Y_RNA.67-201ENST00000362870 100 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 Y_RNA.144-201ENST00000363521 113 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 RNU6-1066P-201ENST00000363573 105 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 AL603766.1-201ENST00000407763 664 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 YWHAZP3-201ENST00000415292 738 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 AC231533.2-201ENST00000419045 978 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 AC062016.2-201ENST00000420950 676 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 USP9YP36-201ENST00000424581 829 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 SDCBPP2-201ENST00000424643 885 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 GAPDHP51-201ENST00000426454 1000 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 AC009228.1-203ENST00000430105 432 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 AF274573.1-201ENST00000430535 494 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 AC093716.1-201ENST00000435923 377 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 RPS10P14-201ENST00000440748 502 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 AC106869.1-202ENST00000441997 604 ntTSL 4 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 AL161725.2-201ENST00000442442 403 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 MTND6P13-201ENST00000443510 523 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 Z80107.2-201ENST00000445127 392 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 AC233279.1-201ENST00000455300 423 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 YRDCP3-201ENST00000456507 480 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 RN7SL55P-201ENST00000464534 297 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 SLC7A11-AS1-201ENST00000510066 817 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 MTND6P2-201ENST00000512226 524 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 MTND5P4-201ENST00000514978 288 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 AP003467.1-201ENST00000517397 301 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 PHBP2-201ENST00000532859 806 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 AC084879.2-201ENST00000551656 369 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 AL352984.1-201ENST00000556949 276 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 HMGN1P26-201ENST00000558737 303 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 SLC12A1-210ENST00000561031 735 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 AC023813.3-201ENST00000561876 539 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 AL355375.2-201ENST00000574825 175 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 MIR3680-2-201ENST00000578247 87 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 MIR3680-1-201ENST00000581433 87 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 AC090506.1-201ENST00000583089 572 ntTSL 4 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 H3F3BP2-201ENST00000583907 357 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 PRR13P5-201ENST00000596581 442 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 AL390058.1-201ENST00000603834 629 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
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