Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 RSU1P2-203ENST00000448600 1582 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
IFT88Q13099 AC091305.2-201ENST00000624049 1576 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
IFT88Q13099 AC103740.1-201ENST00000558888 7427 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.49
IFT88Q13099 ING3-201ENST00000315870 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
IFT88Q13099 AP001267.1-201ENST00000531742 2074 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.49
IFT88Q13099 AL450326.2-201ENST00000421913 1962 ntBASIC5.71□□□□□ -1.49
IFT88Q13099 PDE4D-205ENST00000360047 3122 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 HSPD1P9-201ENST00000420325 1636 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 ANAPC1P1-201ENST00000426186 2145 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 ZNF420-202ENST00000337995 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 ELF2-203ENST00000379550 3278 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 MYB-226ENST00000528774 2277 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 IL1RAPL1-202ENST00000378993 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 TMBIM4-203ENST00000398033 844 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 AL512430.2-201ENST00000406786 339 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 AC106900.1-201ENST00000418620 456 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 AL139008.2-201ENST00000420315 395 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 AL162430.2-201ENST00000422306 435 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 LINC02532-206ENST00000433965 570 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 AL445928.1-201ENST00000435545 222 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 AL353662.1-201ENST00000439099 327 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 AC012512.1-201ENST00000446594 718 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 MTND4LP12-201ENST00000448237 295 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 AL445466.1-201ENST00000448432 357 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 AC023245.1-201ENST00000468501 517 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 RPS17P5-201ENST00000498293 408 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 AC017091.1-202ENST00000510941 504 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 PRMT5P1-201ENST00000514351 598 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 GPRC5D-AS1-203ENST00000536029 466 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 AC244502.1-203ENST00000541008 576 ntTSL 4 BASIC5.71□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 A2MP1-201ENST00000543404 1201 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 AC090502.3-201ENST00000552046 529 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 AL355838.1-201ENST00000554814 559 ntTSL 4 BASIC5.71□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 AC020704.1-201ENST00000559394 454 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 POU1F1-203ENST00000560656 647 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 AC092332.1-201ENST00000563684 829 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 AC002519.2-203ENST00000567043 837 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 U95743.1-201ENST00000573369 1001 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 AC127024.5-201ENST00000580085 462 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 MIR7853-201ENST00000584820 132 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 NANOGP3-201ENST00000605855 286 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 MIR6721-201ENST00000617181 87 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 AC079906.1-201ENST00000621214 815 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 AD000090.1-201ENST00000638356 494 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 AC134980.1-203ENST00000640541 570 ntTSL 4 BASIC5.71□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 OR2AK2-202ENST00000641852 1008 ntAPPRIS P2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 CARD6-201ENST00000254691 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 DCLK1-204ENST00000379893 4612 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 KCNJ16-202ENST00000392670 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 MYBPC1-205ENST00000536007 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 MYBPC1-206ENST00000541119 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 CEP295-206ENST00000531700 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 AC011503.1-201ENST00000596326 1585 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 AL513548.1-201ENST00000562904 1724 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 GOLPH3L-201ENST00000271732 2999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 SRRM1-202ENST00000374389 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 AL158835.1-203ENST00000415305 3149 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 FLJ46284-201ENST00000504861 3421 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 LZTFL1-216ENST00000539217 4113 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 AL731532.2-201ENST00000623542 1953 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 CRYBA1-201ENST00000225387 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 GLYAT-201ENST00000278400 1150 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 GKN1-201ENST00000377938 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 RNU6-1263P-201ENST00000384601 106 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 NPM1P40-201ENST00000412758 733 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 MTND4LP21-201ENST00000415303 295 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 LINC01114-201ENST00000421071 482 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 AL137071.1-201ENST00000422150 243 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 AC092447.2-201ENST00000435487 669 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 RPS12P17-201ENST00000438591 377 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 AL606534.1-201ENST00000439562 694 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 RPL5P7-201ENST00000444235 813 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 AC022387.1-201ENST00000444770 794 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 AL049649.1-201ENST00000444792 1105 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 AC073476.1-201ENST00000452854 407 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 RPS6P2-201ENST00000454208 705 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 RNU1-88P-201ENST00000459274 128 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 KDELR2-206ENST00000490996 655 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 AC106822.1-201ENST00000502647 526 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 AC115622.1-201ENST00000509628 587 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 RNU6-943P-201ENST00000516960 98 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 AC090572.3-201ENST00000519041 804 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 AC079064.1-201ENST00000528365 362 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 AP006259.1-201ENST00000528520 561 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 AP002370.2-201ENST00000531424 545 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 AC007406.1-201ENST00000544067 315 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 SULT1C2P2-201ENST00000562517 294 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 ARGFXP2-201ENST00000579304 949 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 SNORD39.2-201ENST00000579995 76 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 SEPT4-AS1-202ENST00000580589 653 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 MIR4472-2-201ENST00000582069 67 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 GTSCR1-201ENST00000582578 470 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 AC243756.1-201ENST00000584068 660 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 APOC2-205ENST00000592257 444 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 Z99755.2-201ENST00000610215 364 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 NEK3-211ENST00000629912 141 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 DARS-AS1-230ENST00000631306 530 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 ITGB1-201ENST00000302278 3640 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 ZNF678-201ENST00000343776 8556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 KCNJ10-205ENST00000638728 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.4 ms