Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 RNU6-1334P-201ENST00000516032 105 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
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PGGT1BP53609 OR10D4P-201ENST00000525892 951 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
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PGGT1BP53609 MRE11-203ENST00000393241 2604 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.52
PGGT1BP53609 GRIK2-203ENST00000369134 4185 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.52
PGGT1BP53609 CLEC12B-202ENST00000396502 3029 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
PGGT1BP53609 LARP4-203ENST00000398473 6427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
PGGT1BP53609 DDAH1-204ENST00000535924 3909 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
PGGT1BP53609 DCC-202ENST00000412726 9525 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
PGGT1BP53609 AC098798.1-201ENST00000503998 1447 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PGGT1BP53609 F9-201ENST00000218099 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
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