Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 OLA1P3-201ENST00000550756 2555 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 DDX3Y-202ENST00000360160 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 WDPCP-201ENST00000272321 3392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 TFF1-201ENST00000291527 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 DAW1-201ENST00000309931 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 AC104699.1-201ENST00000352271 414 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 FAM107A-201ENST00000360997 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 RNA5SP174-201ENST00000362702 118 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 RNA5SP150-201ENST00000362969 119 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 RN7SKP211-201ENST00000363328 315 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 RNU6-263P-201ENST00000363811 107 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 RNU4-56P-201ENST00000364700 142 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 RN7SKP269-201ENST00000365545 319 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 IGLV3-16-201ENST00000390311 385 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 TRAJ32-201ENST00000390505 66 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 RAB1C-201ENST00000409159 606 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 RNU4-30P-201ENST00000410245 143 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 UQCRHP2-201ENST00000415651 288 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 FTOP1-201ENST00000419363 861 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 FAM236D-201ENST00000419795 433 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 SDCBP-203ENST00000424270 1277 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 AL136084.2-202ENST00000433997 353 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 RPL23AP58-201ENST00000440453 469 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 CPSF7-206ENST00000448745 1749 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 GAS5-219ENST00000449289 542 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 AC010974.1-201ENST00000450509 374 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 AL390778.1-201ENST00000452377 527 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 AC246785.3-201ENST00000455105 314 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 AC092422.1-201ENST00000455576 584 ntTSL 4 BASIC10.03□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 FAM236D-202ENST00000458170 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 CMAHP-203ENST00000458373 1101 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 AC123768.1-202ENST00000460684 461 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 AC026798.1-201ENST00000468490 482 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 RPL30P11-201ENST00000495304 339 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 AC024581.1-201ENST00000514791 566 ntTSL 4 BASIC10.03□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 CCT5-213ENST00000515390 1728 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 CCAR2-208ENST00000521301 337 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 AC131025.1-201ENST00000521756 588 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 RIMBP2-202ENST00000535703 3685 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 ENTPD1-210ENST00000543964 1579 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 FLVCR2-204ENST00000553587 584 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 AC099314.1-201ENST00000563916 562 ntTSL 4 BASIC10.03□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 ZNF174-203ENST00000571936 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
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HOXD11P31277 AL132655.1-201ENST00000601795 1153 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
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HOXD11P31277 AC244196.3-201ENST00000614171 374 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 GOLGA6D-202ENST00000618219 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
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HOXD11P31277 FAM236C-202ENST00000636532 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 CFAP65-202ENST00000341552 5953 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 MROH5-201ENST00000430863 4164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 CTCFL-201ENST00000243914 3567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 KCNB2-201ENST00000523207 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 OVCH1-201ENST00000318184 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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HOXD11P31277 AC090198.1-201ENST00000518639 2355 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
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HOXD11P31277 TIMM21-201ENST00000169551 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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HOXD11P31277 UEVLD-208ENST00000535484 1963 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 AC100756.3-201ENST00000618455 1816 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 PDXDC1-202ENST00000396410 4521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 ZEB2-217ENST00000470879 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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HOXD11P31277 SELENOP-214ENST00000514985 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
HOXD11P31277 DOCK2-201ENST00000256935 6097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
HOXD11P31277 SNHG14-208ENST00000453082 6087 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
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HOXD11P31277 PTPRK-221ENST00000532331 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
HOXD11P31277 AC008739.5-201ENST00000623035 1938 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
HOXD11P31277 ATAD2B-201ENST00000238789 8103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
HOXD11P31277 RPL23AP87-201ENST00000425566 2256 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
HOXD11P31277 AP006222.1-203ENST00000441866 2256 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
HOXD11P31277 PAMR1-207ENST00000619888 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
HOXD11P31277 KLK7-205ENST00000595820 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
HOXD11P31277 CAPRIN1-209ENST00000530820 3454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
HOXD11P31277 OR2T7-201ENST00000641057 3463 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
HOXD11P31277 PSENEN-201ENST00000222266 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
HOXD11P31277 FASLG-201ENST00000340030 917 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
HOXD11P31277 IGFL3-201ENST00000341415 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
HOXD11P31277 ITGAL-202ENST00000358164 4673 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
HOXD11P31277 Y_RNA.75-201ENST00000362927 97 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
HOXD11P31277 MIR521-1-201ENST00000384902 87 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
HOXD11P31277 CYCSP5-201ENST00000415043 297 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
HOXD11P31277 AC128709.3-201ENST00000420213 626 ntTSL 4 BASIC10.02□□□□□ -0.81
HOXD11P31277 HCG25-217ENST00000422366 702 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
HOXD11P31277 AC004870.2-202ENST00000423781 706 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
HOXD11P31277 AC092573.2-201ENST00000434546 243 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
HOXD11P31277 RPL12P18-201ENST00000437175 325 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
HOXD11P31277 RPSA-202ENST00000443003 1032 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
HOXD11P31277 AL355497.2-201ENST00000456346 880 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
HOXD11P31277 AC022795.1-201ENST00000473808 480 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
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