Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 MIR4420-201ENST00000583944 77 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 AC114684.1-201ENST00000587659 352 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 AC024592.1-202ENST00000590441 341 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 LINC01587-204ENST00000623565 873 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 AC026951.1-201ENST00000559530 2459 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 RAB3GAP1-207ENST00000539493 3161 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 LINC01787-201ENST00000435311 1994 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 CSNK1G1-204ENST00000606793 1658 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 NF1-201ENST00000356175 12362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 DLGAP1-AS2-202ENST00000573177 1388 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 RAPGEF2-201ENST00000264431 6949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 TMEM257-201ENST00000408967 2441 ntAPPRIS P1 BASIC6.41□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 MYBPC1-209ENST00000547509 3749 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 DDX58-201ENST00000379868 4089 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 AL391261.1-201ENST00000555712 1479 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 KCNJ1-206ENST00000440599 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 LINC01361-202ENST00000452834 1526 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 NSD3-206ENST00000527502 4471 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 ZNF571-201ENST00000328550 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 SCN1A-203ENST00000409050 5946 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 RNU1-43P-201ENST00000365052 165 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 GPR52-201ENST00000367685 1088 ntAPPRIS P1 BASIC6.41□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 CENPW-203ENST00000368328 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 RRM2B-203ENST00000395912 900 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 RNU6ATAC21P-201ENST00000408656 126 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 BX470102.1-201ENST00000420695 531 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 TPT1P13-201ENST00000449760 499 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 AC009220.1-201ENST00000451614 275 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 LINC01340-201ENST00000504012 724 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 AC106864.2-201ENST00000505632 740 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 AC138409.2-202ENST00000507274 458 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 MOCS2-205ENST00000508922 1210 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 RNU6ATAC24P-201ENST00000516811 135 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 E2F5-204ENST00000517476 1094 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 LINC02307-201ENST00000553827 257 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 AC091117.1-201ENST00000560967 426 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 MOCS2-209ENST00000582677 741 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 AC005084.1-201ENST00000605160 304 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 AC068631.1-223ENST00000625877 472 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 ADAM18-201ENST00000265707 2388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 DNA2-208ENST00000551118 3468 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 TRPC4-202ENST00000355779 2784 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 AP004607.3-201ENST00000530354 3915 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 SLC10A7-202ENST00000394059 1730 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 CASC11-201ENST00000502463 3301 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 OR51I2-202ENST00000641930 3302 ntAPPRIS P1 BASIC6.41□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 USP9YP3-201ENST00000434481 1766 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 DCN-204ENST00000425043 1438 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 PSG1-202ENST00000312439 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 CR1-201ENST00000367049 7470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 STYX-202ENST00000442123 4554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 XKRY2-202ENST00000623874 1581 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 XKRY-202ENST00000624960 1581 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 AC232271.1-201ENST00000602455 2715 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 ADTRP-201ENST00000229583 891 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 PIH1D2-201ENST00000280350 1241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 OR4K13-201ENST00000315693 915 ntAPPRIS P1 BASIC6.4□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 MIR141-201ENST00000384975 95 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 TRAV8-7-201ENST00000390456 341 ntAPPRIS P1 BASIC6.4□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 C6orf48-208ENST00000395788 815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 U3.36-201ENST00000408418 213 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 AL445213.1-201ENST00000412589 747 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 RPS6P23-201ENST00000413224 722 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 AL592402.1-201ENST00000417161 440 ntTSL 4 BASIC6.4□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 AL139008.2-201ENST00000420315 395 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 AC007562.1-201ENST00000421819 517 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 SRSF1P1-201ENST00000424058 520 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 AL035404.2-201ENST00000424418 304 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 AC093655.2-201ENST00000425735 631 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 PIH1D2-202ENST00000431456 1245 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 ATP13A4-AS1-202ENST00000431512 394 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 AL049745.1-201ENST00000433953 286 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 AL392089.1-202ENST00000444793 449 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 HCG14-201ENST00000444986 413 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 AC023274.2-201ENST00000445264 521 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 AL022319.1-201ENST00000458183 1167 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 MORC1-AS1-201ENST00000480826 564 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 AC068522.1-201ENST00000482895 345 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 RPL38P3-201ENST00000484463 213 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 AC114956.1-201ENST00000504277 512 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 MYLK-AS2-201ENST00000510827 500 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 LNX1-AS1-204ENST00000514364 495 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 AC020937.1-201ENST00000519677 1013 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 BMPR1APS2-201ENST00000527904 1012 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 OR8G3P-201ENST00000533406 921 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 NOP10-202ENST00000557912 436 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 MIR3934-201ENST00000579806 107 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 AC015845.1-202ENST00000580184 242 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 AC107926.1-201ENST00000581673 621 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 AC015878.1-201ENST00000584611 679 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 AC027334.1-201ENST00000603257 310 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 AL445465.1-206ENST00000609544 528 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 MIR4435-2HG-220ENST00000609902 603 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 AC015574.1-205ENST00000611285 524 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 AJ239318.1-201ENST00000624445 607 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 AL353662.3-201ENST00000625131 237 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 AP001153.1-201ENST00000641024 338 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 GABRA1-218ENST00000637827 1838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 POT1-202ENST00000393329 3950 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
HOXD10P28358 AC006484.1-201ENST00000435086 1884 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
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