Protein–RNA interactions for Protein: P19838

NFKB1, Nuclear factor NF-kappa-B p105 subunit, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKB1P19838 KAT6B-203ENST00000372714 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 CCNB3-202ENST00000348603 1201 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 SNORA4.1-201ENST00000364263 144 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 OR10R2-201ENST00000368152 1008 ntAPPRIS P2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 CCNB3-203ENST00000376038 1201 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 Y_RNA.450-201ENST00000384198 113 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 Y_RNA.535-201ENST00000384612 99 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 IGLV5-52-201ENST00000390289 379 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 MFAP5-202ENST00000396549 1195 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 AC003045.1-201ENST00000398779 713 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 AC005323.2-201ENST00000399342 583 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 MORN2-202ENST00000409077 465 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 AC009411.1-202ENST00000412424 548 ntTSL 4 BASIC7.25□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 RPL21P32-201ENST00000419877 477 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 UQCRHP1-204ENST00000424609 274 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 AC233728.2-201ENST00000425348 757 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 MYO5BP3-201ENST00000431872 1279 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 NIP7P1-201ENST00000433227 512 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 AL136099.1-201ENST00000436492 557 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
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NFKB1P19838 AC023512.1-201ENST00000444513 499 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 AC006458.1-201ENST00000445093 653 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 NPPA-AS1-202ENST00000446542 1032 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 Z99127.3-201ENST00000448158 395 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 AL354872.1-201ENST00000456361 967 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 AC092832.2-201ENST00000456621 389 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 AL445488.1-201ENST00000457272 706 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 ANK3-207ENST00000460468 677 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 RPL5P24-201ENST00000463742 885 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 MTND1P16-201ENST00000465177 898 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 AL079303.1-201ENST00000486611 463 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 AC079594.1-201ENST00000489757 331 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 RN7SL306P-201ENST00000492941 296 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 AC025465.2-201ENST00000502809 608 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 AC114912.1-201ENST00000503394 546 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
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NFKB1P19838 AC115622.1-201ENST00000509628 587 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 AC138866.1-201ENST00000514522 497 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 AC062004.1-201ENST00000518706 686 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 IGHV3-32-201ENST00000519182 355 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 TPT1-AS1-213ENST00000521336 759 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 AC026979.2-201ENST00000523733 583 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 LINC02389-202ENST00000540024 557 ntTSL 4 BASIC7.25□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 AC073487.1-201ENST00000547009 529 ntTSL 4 BASIC7.25□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 AC009387.1-201ENST00000549163 441 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 TGFB3-AS1-201ENST00000553732 580 ntTSL 4 BASIC7.25□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 AC116903.1-201ENST00000557683 539 ntTSL 4 BASIC7.25□□□□□ -1.25
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NFKB1P19838 AP005121.1-201ENST00000578243 469 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
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NFKB1P19838 PIGN-217ENST00000591238 1622 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 AC096582.3-201ENST00000636578 3716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 CNOT1-216ENST00000569240 7660 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 CNOT4-206ENST00000428680 4642 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 ATP1B4-203ENST00000539306 4644 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
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NFKB1P19838 DCX-206ENST00000496551 1320 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 MDM4-215ENST00000614459 9782 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 NEXMIF-203ENST00000616200 10624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 TRIM5-203ENST00000396847 3170 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 FOCAD-216ENST00000605086 4195 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 CXCR6-204ENST00000458629 2805 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 HTR2A-203ENST00000543956 4689 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 SLC10A7-202ENST00000394059 1730 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 RAG1-201ENST00000299440 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
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NFKB1P19838 LINC02447-201ENST00000499242 1500 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
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NFKB1P19838 MTIF3-203ENST00000405591 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
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NFKB1P19838 RN7SKP254-201ENST00000410685 310 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
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NFKB1P19838 DYDC1-203ENST00000421924 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
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NFKB1P19838 AC009237.4-201ENST00000441078 238 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 AL354936.1-201ENST00000441521 649 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 AL121957.1-201ENST00000441532 338 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 DBIL5P2-201ENST00000443827 253 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 RPL7P36-201ENST00000444633 681 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 SNORA81.1-201ENST00000458922 177 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 RPL23AP37-201ENST00000479658 549 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
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