Protein–RNA interactions for Protein: P16422

EPCAM, Epithelial cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPCAMP16422 OR5AQ1P-203ENST00000641818 1529 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
EPCAMP16422 TMEM257-201ENST00000408967 2441 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
EPCAMP16422 AC068769.1-201ENST00000474767 2426 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
EPCAMP16422 FIGN-201ENST00000333129 9536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
EPCAMP16422 IFIT2-201ENST00000371826 3489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
EPCAMP16422 ESRRG-204ENST00000361525 5363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
EPCAMP16422 ARHGAP20-206ENST00000533353 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
EPCAMP16422 GRIA4-204ENST00000428631 2778 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
EPCAMP16422 AC007159.1-201ENST00000566529 4706 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
EPCAMP16422 PSMC6-219ENST00000612399 1590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
EPCAMP16422 AL161911.1-202ENST00000464488 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
EPCAMP16422 CASC19-255ENST00000641733 1385 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
EPCAMP16422 PSG11-201ENST00000306322 990 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
EPCAMP16422 FNIP1-202ENST00000307968 6388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
EPCAMP16422 OR5H1-201ENST00000354565 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
EPCAMP16422 MIR133B-201ENST00000362210 119 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
EPCAMP16422 OR2J2-202ENST00000377167 1272 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
EPCAMP16422 SH3BGR-203ENST00000380634 816 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
EPCAMP16422 SNORA70.9-201ENST00000384370 135 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
EPCAMP16422 RPL37P18-201ENST00000411602 243 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
EPCAMP16422 AP000221.1-201ENST00000419694 1046 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
EPCAMP16422 NIPA2P1-201ENST00000426223 976 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
EPCAMP16422 CLYBL-AS2-201ENST00000430125 695 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
EPCAMP16422 FAM96AP1-201ENST00000430879 482 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
EPCAMP16422 AC105399.1-202ENST00000447303 205 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
EPCAMP16422 AP001604.1-201ENST00000447384 954 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
EPCAMP16422 AADACP1-204ENST00000483636 1285 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
EPCAMP16422 RN7SL97P-201ENST00000486780 299 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
EPCAMP16422 AC010230.1-201ENST00000514115 443 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
EPCAMP16422 AP001804.1-201ENST00000526868 919 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
EPCAMP16422 AP001266.2-201ENST00000534505 464 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
EPCAMP16422 PCBP1-AS1-286ENST00000625888 765 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
EPCAMP16422 INO80D-201ENST00000403263 14136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
EPCAMP16422 IARS-213ENST00000627121 4587 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
EPCAMP16422 OR51E2-203ENST00000641638 2626 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
EPCAMP16422 AP000547.3-204ENST00000588548 2523 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
EPCAMP16422 ARIH1-201ENST00000379887 21681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
EPCAMP16422 TTC21B-201ENST00000243344 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
EPCAMP16422 TTF2-201ENST00000369466 9462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
EPCAMP16422 TRRAP-204ENST00000446306 12492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
EPCAMP16422 PSG1-202ENST00000312439 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
EPCAMP16422 RAPH1-207ENST00000423104 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
EPCAMP16422 ZFYVE16-206ENST00000510158 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
EPCAMP16422 AC079601.1-201ENST00000547824 2791 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
EPCAMP16422 ART3-202ENST00000349321 1528 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
EPCAMP16422 KLHL41-201ENST00000284669 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
EPCAMP16422 RABGAP1L-208ENST00000392064 6282 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
EPCAMP16422 CYBB-201ENST00000378588 4324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
EPCAMP16422 SLC12A6-218ENST00000560611 4239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
EPCAMP16422 FBXO3-213ENST00000534136 3217 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
EPCAMP16422 AC092378.1-202ENST00000500117 2296 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
EPCAMP16422 ALKBH8-205ENST00000428149 4079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
EPCAMP16422 DHX32-201ENST00000284690 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
EPCAMP16422 RNU1-43P-201ENST00000365052 165 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
EPCAMP16422 AC012358.3-203ENST00000366287 1110 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
EPCAMP16422 APOOL-201ENST00000373173 1279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
EPCAMP16422 MRRF-207ENST00000373729 870 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
EPCAMP16422 F9-202ENST00000394090 1272 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
EPCAMP16422 RNA5SP251-201ENST00000410614 137 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
EPCAMP16422 AC012368.2-201ENST00000423539 560 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
EPCAMP16422 DSTNP5-201ENST00000427921 523 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
EPCAMP16422 VN1R54P-201ENST00000435210 1049 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
EPCAMP16422 AL772161.1-201ENST00000439130 476 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
EPCAMP16422 EIF4EBP2P1-201ENST00000450009 343 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
EPCAMP16422 OSTCP1-201ENST00000455507 450 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
EPCAMP16422 CDKN3-205ENST00000458126 845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
EPCAMP16422 NECTIN3-AS1-205ENST00000491709 792 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
EPCAMP16422 GYPB-202ENST00000502664 521 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
EPCAMP16422 SERF1B-203ENST00000503931 569 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
EPCAMP16422 SERF1A-204ENST00000504458 569 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
EPCAMP16422 NDUFB5P1-201ENST00000508134 564 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
EPCAMP16422 LNX1-AS1-204ENST00000514364 495 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
EPCAMP16422 RN7SKP67-201ENST00000515905 235 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
EPCAMP16422 AC013644.1-202ENST00000523166 499 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
EPCAMP16422 FAM222A-AS1-202ENST00000541460 751 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
EPCAMP16422 AC066613.1-201ENST00000559977 1053 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
EPCAMP16422 BLOC1S6-209ENST00000565409 616 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
EPCAMP16422 AC005670.2-201ENST00000571841 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
EPCAMP16422 AC011824.2-202ENST00000578602 533 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
EPCAMP16422 MIR4646-201ENST00000580775 63 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
EPCAMP16422 AC107993.1-201ENST00000591343 684 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
EPCAMP16422 CCL14-204ENST00000622526 472 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
EPCAMP16422 AC104461.1-201ENST00000637430 817 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
EPCAMP16422 CUZD1-205ENST00000368904 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
EPCAMP16422 ESRRG-205ENST00000366937 5365 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
EPCAMP16422 ZNF283-203ENST00000588797 2428 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
EPCAMP16422 CTNNA2-202ENST00000361291 3071 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
EPCAMP16422 Z95114.1-201ENST00000624264 14574 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
EPCAMP16422 ATP6V1A-201ENST00000273398 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
EPCAMP16422 MIR4435-2HG-207ENST00000439362 1522 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
EPCAMP16422 AC005224.3-201ENST00000584683 2140 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
EPCAMP16422 SESN1-201ENST00000302071 2718 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
EPCAMP16422 AC006145.1-201ENST00000439234 2651 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
EPCAMP16422 RPE65-201ENST00000262340 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
EPCAMP16422 AC034229.2-201ENST00000566945 2508 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
EPCAMP16422 FBXO25-204ENST00000382824 10386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
EPCAMP16422 DSC3-201ENST00000360428 6939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
EPCAMP16422 SLC7A11-201ENST00000280612 9645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
EPCAMP16422 DCX-211ENST00000637570 6162 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
EPCAMP16422 TMPRSS15-201ENST00000284885 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.5 ms