Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 LINC02505-202ENST00000510597 776 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 KRT19P6-201ENST00000510983 209 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 AC097501.1-202ENST00000514707 313 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 RNU6-718P-201ENST00000516166 105 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 SCARNA5-201ENST00000516201 276 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 AC007207.2-201ENST00000543206 542 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 LINC00520-201ENST00000554186 831 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 AC138305.2-201ENST00000561595 556 ntTSL 4 BASIC7.46□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 BGLT3-201ENST00000564523 994 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 AC090826.1-203ENST00000569235 490 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 AC134669.1-201ENST00000581275 672 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 AC010327.4-201ENST00000585911 857 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 AC006504.5-201ENST00000588122 655 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 BMS1P7-201ENST00000602440 1052 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 AC004805.3-201ENST00000603178 310 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 AL499605.1-201ENST00000604628 403 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 IGKV2OR2-1-201ENST00000605129 304 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 AC092902.3-201ENST00000610060 373 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 AL589743.6-201ENST00000611025 117 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 SMR3B-204ENST00000614072 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 Six3os1_4.1-201ENST00000615706 324 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 ZNF248-209ENST00000615949 518 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 AC009120.7-201ENST00000623452 780 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 AC073593.1-201ENST00000624500 411 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 RNF146-215ENST00000616343 2077 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 MDGA2-203ENST00000426342 2871 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 OR2T6-202ENST00000641644 4670 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 CDH2-202ENST00000399380 3737 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 GIF-201ENST00000257248 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 CLCC1-203ENST00000356970 4803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 MFSD8-218ENST00000641186 4448 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 LINC00922-203ENST00000569736 1760 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 MED13L-201ENST00000281928 14234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 RBM23-203ENST00000359890 10040 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 CCDC178-209ENST00000579947 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 RNF145-201ENST00000274542 3364 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 AC004014.2-201ENST00000623718 5122 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 PHACTR2-201ENST00000305766 1851 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 ADA2-203ENST00000399837 4505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 C11orf63-203ENST00000531316 2782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 TTC39DP-201ENST00000416781 1688 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 RBM41-202ENST00000372487 2579 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 AC019270.1-201ENST00000523495 3488 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 ZHX3-205ENST00000432768 3551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 TRMT13-202ENST00000370141 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 OR1I1-201ENST00000209540 1242 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 AC016716.1-201ENST00000265882 708 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 SMR3B-201ENST00000304915 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 OR4K5-201ENST00000315915 1078 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 ZBTB8OS-202ENST00000373501 598 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 OR2A2-201ENST00000408979 1051 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 RNU2-66P-201ENST00000410650 161 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 AC004014.1-201ENST00000413406 538 ntTSL 4 BASIC7.45□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 AL049765.1-201ENST00000416237 573 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 BTF3P9-201ENST00000418784 283 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 MTCO3P1-205ENST00000422088 832 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 AC005009.1-201ENST00000423979 269 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 AL353801.1-201ENST00000425541 425 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 PRH1-201ENST00000428168 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 AC239367.3-201ENST00000428996 814 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 HTR5BP-202ENST00000434708 1193 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 ELOCP10-201ENST00000440624 327 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 LINC01789-201ENST00000443123 860 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 AL353898.1-201ENST00000444055 238 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 MTOR-AS1-202ENST00000445982 705 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 AC011752.1-201ENST00000451476 494 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 PCBP1-AS1-237ENST00000452431 1194 ntTSL 4 BASIC7.45□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 CCNJP2-201ENST00000457810 1163 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 ZBTB8OS-205ENST00000465588 548 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 AC090589.1-201ENST00000473109 362 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 RPL7P18-201ENST00000478965 734 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 RN7SL569P-201ENST00000494652 288 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 LINC02215-201ENST00000503320 543 ntTSL 4 BASIC7.45□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 AC122718.2-201ENST00000505325 591 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 AC112198.1-201ENST00000505369 1220 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 SSX8-201ENST00000506270 579 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 AC034226.1-201ENST00000506429 487 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 AC018797.1-201ENST00000510791 255 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 AC107884.2-201ENST00000530963 550 ntTSL 4 BASIC7.45□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 AL136146.2-201ENST00000534594 494 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 EEF1A1P17-201ENST00000547505 1275 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 AL161757.4-202ENST00000557467 737 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 AC007496.2-201ENST00000564801 547 ntTSL 4 BASIC7.45□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 AC023813.1-201ENST00000565055 306 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 AC092718.4-201ENST00000566639 716 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 AC106785.4-201ENST00000569492 412 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 AC011468.3-201ENST00000597886 332 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 AC083899.3-201ENST00000603413 594 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 AC112230.1-201ENST00000604342 547 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 ELOCP34-201ENST00000604436 327 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 AC091946.2-201ENST00000606105 291 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 RNU4-89P-201ENST00000607443 133 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 AC091768.1-201ENST00000609258 930 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 FP236315.3-201ENST00000623587 307 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 AC034229.6-201ENST00000623704 224 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 C7orf66-201ENST00000624695 435 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 PCBP1-AS1-348ENST00000629506 667 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 AL121936.2-201ENST00000641935 662 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 PIGN-233ENST00000639342 4305 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 CABYR-216ENST00000621648 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
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