Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 DUTP1-201ENST00000493631 470 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SAMD8Q96LT4 AC092666.1-203ENST00000495144 698 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SAMD8Q96LT4 AC008592.2-201ENST00000506070 571 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SAMD8Q96LT4 AC020937.1-201ENST00000519677 1013 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SAMD8Q96LT4 AC103726.2-201ENST00000523318 411 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SAMD8Q96LT4 AC068389.4-201ENST00000531379 689 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SAMD8Q96LT4 AC137627.1-201ENST00000545761 289 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SAMD8Q96LT4 LINC02411-203ENST00000546180 959 ntTSL 4 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SAMD8Q96LT4 AC009117.3-202ENST00000563825 557 ntTSL 4 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SAMD8Q96LT4 AC092316.1-201ENST00000598703 297 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SAMD8Q96LT4 AC104836.2-201ENST00000609675 1293 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
SAMD8Q96LT4 CCL23-201ENST00000612516 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
SAMD8Q96LT4 AC004801.6-201ENST00000616571 978 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SAMD8Q96LT4 RMST_5.1-201ENST00000618704 126 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SAMD8Q96LT4 SLFN5-201ENST00000299977 10591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
SAMD8Q96LT4 PPP1R9A-206ENST00000433360 5369 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
SAMD8Q96LT4 AP000473.2-201ENST00000602659 1537 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SAMD8Q96LT4 UNC80-203ENST00000439458 13562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SAMD8Q96LT4 NCOA1-206ENST00000407230 4745 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
SAMD8Q96LT4 RAB30-212ENST00000533486 9929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
SAMD8Q96LT4 ATF2-202ENST00000345739 4079 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
SAMD8Q96LT4 SYTL2-204ENST00000389958 1943 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SAMD8Q96LT4 CASC19-281ENST00000642118 1554 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SAMD8Q96LT4 BBX-201ENST00000325805 3517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
SAMD8Q96LT4 LINC00598-206ENST00000615947 3541 ntTSL 4 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SAMD8Q96LT4 IQCH-214ENST00000629425 1822 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
SAMD8Q96LT4 PDE10A-203ENST00000539869 4401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
SAMD8Q96LT4 LINC00707-201ENST00000436383 3070 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SAMD8Q96LT4 RNF19A-205ENST00000519449 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
SAMD8Q96LT4 ZNF260-204ENST00000592282 5055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
SAMD8Q96LT4 GPR87-201ENST00000260843 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
SAMD8Q96LT4 AC006484.1-201ENST00000435086 1884 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SAMD8Q96LT4 AL354854.1-201ENST00000455940 1363 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SAMD8Q96LT4 GRAMD2B-202ENST00000502348 1363 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SAMD8Q96LT4 MCF2L2-202ENST00000414362 3031 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SAMD8Q96LT4 ZMAT1-201ENST00000372782 3185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
SAMD8Q96LT4 SSX3-201ENST00000298396 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
SAMD8Q96LT4 OR8U1-201ENST00000302270 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SAMD8Q96LT4 AL353751.1-201ENST00000354541 495 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SAMD8Q96LT4 PLEKHA1-203ENST00000368990 14010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
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SAMD8Q96LT4 AC096921.1-201ENST00000411661 375 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SAMD8Q96LT4 LINC00701-201ENST00000418295 742 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
SAMD8Q96LT4 AL158166.2-201ENST00000420845 748 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
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SAMD8Q96LT4 CCDC17-203ENST00000445048 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
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SAMD8Q96LT4 LINC01125-249ENST00000627399 1067 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
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SAMD8Q96LT4 CD200R1L-204ENST00000488794 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SAMD8Q96LT4 AC087257.1-201ENST00000506925 2639 ntTSL 4 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SAMD8Q96LT4 SLC35F5-213ENST00000638402 1554 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SAMD8Q96LT4 F9-201ENST00000218099 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
SAMD8Q96LT4 ADGRG2-203ENST00000356606 4630 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
SAMD8Q96LT4 NR3C2-202ENST00000344721 5712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SAMD8Q96LT4 RFX4-201ENST00000229387 3378 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
SAMD8Q96LT4 HYAL4-202ENST00000476325 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
SAMD8Q96LT4 ALB-220ENST00000621628 1606 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SAMD8Q96LT4 CDON-206ENST00000531738 5803 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
SAMD8Q96LT4 MYO5A-201ENST00000356338 11971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
SAMD8Q96LT4 GVINP1-202ENST00000531871 7271 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SAMD8Q96LT4 EXPH5-201ENST00000265843 10187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
SAMD8Q96LT4 ESRRG-219ENST00000487276 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
SAMD8Q96LT4 AL121950.1-201ENST00000624993 2077 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SAMD8Q96LT4 MYBPC1-203ENST00000392934 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SAMD8Q96LT4 ALB-202ENST00000401494 1659 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SAMD8Q96LT4 C17orf78-203ENST00000611038 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SAMD8Q96LT4 AL022311.1-201ENST00000623726 19416 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SAMD8Q96LT4 ERCC6L-201ENST00000334463 4243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
SAMD8Q96LT4 PRIM2-201ENST00000274891 864 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
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