Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 LINC01741-201ENST00000427173 1666 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 CHORDC1-206ENST00000529987 1698 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 PROX1-AS1-202ENST00000433082 5266 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 RBM11-201ENST00000400577 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 SLCO1B7-201ENST00000421593 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 TIPARP-205ENST00000486483 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 CPB2-AS1-202ENST00000606243 2185 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 ADAM2-201ENST00000265708 2672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 BIRC6-201ENST00000421745 15703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AC217777.1-201ENST00000570034 1471 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 DDX24-201ENST00000330836 2738 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 FBXL13-207ENST00000455112 2274 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 CD53-201ENST00000271324 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 CEACAM20-202ENST00000614577 1530 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 CLEC7A-202ENST00000304084 1130 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 OR4M1-201ENST00000315957 1116 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 CSN2-201ENST00000353151 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 KITLG-203ENST00000357116 565 ntTSL 4 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 HHLA3-201ENST00000359875 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 MDM2-207ENST00000360430 891 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.38-201ENST00000362617 102 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.61-201ENST00000362835 102 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP298-201ENST00000364991 111 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 PARP1-201ENST00000366790 570 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 VGLL1-201ENST00000370634 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 SNORA30-201ENST00000384028 129 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 RNU6-769P-201ENST00000384407 104 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 COX6B1-202ENST00000392201 435 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 KRTAP9-9-201ENST00000394008 981 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 TNNT3-208ENST00000397301 818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 OR2A25-201ENST00000408898 1014 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 OR6B1-201ENST00000408922 1055 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 LINC01362-201ENST00000419658 338 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AC016710.1-201ENST00000421326 466 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 TSEN15P3-201ENST00000422363 367 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AL669841.1-201ENST00000425723 558 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 RPS27AP6-201ENST00000427962 448 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 LINC00869-202ENST00000430442 1065 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AL590302.1-201ENST00000431017 359 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 ACTG1P21-201ENST00000431536 1000 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AC005006.1-201ENST00000432130 249 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AC099796.1-201ENST00000433377 683 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AC023347.2-201ENST00000433994 462 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 SPAG11A-205ENST00000434307 777 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AC105052.2-201ENST00000434317 794 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AC002486.1-201ENST00000435098 391 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AP000936.3-201ENST00000438127 255 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 CYP3A5-203ENST00000439761 1075 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AP000532.1-201ENST00000440999 177 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AC244021.2-201ENST00000445260 529 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AL589765.3-201ENST00000446084 462 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 TPT1P14-201ENST00000448018 505 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 VNN3-210ENST00000450865 596 ntTSL 4 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 IQCG-204ENST00000453254 1230 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 TRBV21-1-201ENST00000453262 348 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AC019080.2-201ENST00000453859 394 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 RPS15AP17-201ENST00000470598 390 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 RN7SL735P-201ENST00000471015 292 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 RN7SL294P-201ENST00000477271 295 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AC013356.1-201ENST00000489027 564 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AC005912.1-201ENST00000495392 255 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 RPL22-208ENST00000497965 786 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AC025171.2-202ENST00000505541 402 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AC006390.1-201ENST00000508068 283 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 LINC02229-201ENST00000508486 661 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AC094104.2-201ENST00000509718 622 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AC068134.3-201ENST00000513620 788 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 RNU6-358P-201ENST00000516564 75 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 RNU2-46P-201ENST00000517038 113 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AC008429.3-201ENST00000519755 489 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 IGLV3-31-201ENST00000523713 297 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AC025437.1-201ENST00000523820 346 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 TXNRD1-212ENST00000526390 3808 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AC090707.1-201ENST00000528795 396 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AP000781.2-202ENST00000529411 681 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 EBAG9-207ENST00000531677 777 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AP002370.2-203ENST00000533101 576 ntTSL 4 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AC087321.1-201ENST00000539105 460 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 TUBB4BP1-201ENST00000545422 178 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AL133279.1-201ENST00000553487 473 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 RNASE11-206ENST00000553849 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AL512360.1-201ENST00000555346 234 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 SLC12A1-210ENST00000561031 735 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AC138512.1-201ENST00000563190 434 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 HMGN2P40-201ENST00000566875 391 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AC007608.3-202ENST00000570241 1109 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AC069061.2-202ENST00000580280 357 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AC023421.2-202ENST00000586213 547 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AC018761.3-201ENST00000590065 388 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 CKS1BP3-201ENST00000600888 237 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 BNIP3P9-201ENST00000603714 553 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 HSPE1P14-201ENST00000605812 302 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AC008592.5-201ENST00000607856 547 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 STARD13-AS-239ENST00000609588 982 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AL161734.1-201ENST00000609720 557 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 Metazoa_SRP.85-201ENST00000610909 260 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AL109811.3-202ENST00000612387 651 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 MALAT1-209ENST00000616691 587 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AC073255.1-201ENST00000624149 177 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AL021368.4-201ENST00000637710 675 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
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