Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

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Length 555 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 FIRRE-202ENST00000637577 1635 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CCDC96Q2M329 ZNF345-215ENST00000614069 3103 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CCDC96Q2M329 SRGAP1-201ENST00000355086 23331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
CCDC96Q2M329 HORMAD2-202ENST00000403975 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.33
CCDC96Q2M329 HSPD1P7-201ENST00000447985 1686 ntBASIC6.71□□□□□ -1.33
CCDC96Q2M329 OR7C1-203ENST00000641666 11711 ntAPPRIS P1 BASIC6.71□□□□□ -1.33
CCDC96Q2M329 MTCO1P11-201ENST00000429111 1528 ntBASIC6.71□□□□□ -1.33
CCDC96Q2M329 BCL2L14-213ENST00000589718 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CCDC96Q2M329 IQCJ-SCHIP1-205ENST00000527095 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CCDC96Q2M329 MGP-201ENST00000228938 694 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CCDC96Q2M329 AL159987.1-201ENST00000347911 293 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
CCDC96Q2M329 RNA5SP46-201ENST00000362370 120 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
CCDC96Q2M329 AC079355.1-201ENST00000421770 223 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
CCDC96Q2M329 AL360007.1-201ENST00000426166 349 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CCDC96Q2M329 RPS27AP2-201ENST00000457576 465 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
CCDC96Q2M329 AC093719.1-201ENST00000480427 441 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
CCDC96Q2M329 AC006539.1-201ENST00000481419 501 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
CCDC96Q2M329 ENSA-211ENST00000503345 793 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CCDC96Q2M329 AC138866.2-201ENST00000508650 584 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
CCDC96Q2M329 RNA5SP362-201ENST00000516048 118 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
CCDC96Q2M329 AC021678.3-201ENST00000517893 476 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
CCDC96Q2M329 DPPA2P4-201ENST00000563717 878 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
CCDC96Q2M329 MIR4505-201ENST00000582238 73 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
CCDC96Q2M329 AC025278.1-201ENST00000593558 515 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CCDC96Q2M329 AC003682.1-201ENST00000599190 462 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CCDC96Q2M329 ZNF418-210ENST00000600989 597 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CCDC96Q2M329 AL355974.3-201ENST00000617383 467 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
CCDC96Q2M329 DARS-AS1-227ENST00000627442 633 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CCDC96Q2M329 AL355306.2-206ENST00000635233 1903 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CCDC96Q2M329 AIG1-208ENST00000494282 3393 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
CCDC96Q2M329 MAK-203ENST00000474039 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
CCDC96Q2M329 ESRRG-204ENST00000361525 5363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CCDC96Q2M329 MRE11P1-201ENST00000464884 2127 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
CCDC96Q2M329 CFH-201ENST00000359637 1454 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
CCDC96Q2M329 MRE11-203ENST00000393241 2604 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CCDC96Q2M329 SMARCA2-201ENST00000302401 2242 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC96Q2M329 EXD1-201ENST00000314992 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC96Q2M329 CEP85L-201ENST00000360290 1736 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC96Q2M329 GRIA4-204ENST00000428631 2778 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC96Q2M329 OR8G5-203ENST00000641992 1560 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC96Q2M329 LINC00906-206ENST00000589921 3444 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC96Q2M329 HBG1-201ENST00000330597 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC96Q2M329 MIR137-201ENST00000385223 102 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC96Q2M329 BTBD9-203ENST00000403056 1155 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC96Q2M329 RAB9AP4-201ENST00000415230 609 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC96Q2M329 GPC5-AS2-201ENST00000417589 401 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC96Q2M329 AC074011.1-201ENST00000431376 581 ntTSL 4 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC96Q2M329 AC004990.1-201ENST00000431722 564 ntTSL 4 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC96Q2M329 GAPDHP48-201ENST00000436626 961 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC96Q2M329 Z84478.1-201ENST00000438230 1219 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC96Q2M329 AL390879.1-201ENST00000439143 386 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC96Q2M329 FRG2FP-204ENST00000453982 852 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC96Q2M329 OSTCP1-201ENST00000455507 450 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC96Q2M329 AC079080.1-201ENST00000479841 822 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC96Q2M329 OARD1-211ENST00000480585 829 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC96Q2M329 GCSAM-204ENST00000484193 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC96Q2M329 TRBV5-2-201ENST00000489095 273 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC96Q2M329 MORF4L2P1-201ENST00000503761 858 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC96Q2M329 AC068672.3-203ENST00000505166 311 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC96Q2M329 AC034238.3-201ENST00000512349 591 ntTSL 4 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC96Q2M329 WDYHV1-203ENST00000518125 880 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC96Q2M329 WASHC5-AS1-201ENST00000519140 587 ntTSL 4 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC96Q2M329 AP001804.2-201ENST00000533932 910 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC96Q2M329 DUX4L52-201ENST00000549363 777 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC96Q2M329 IGBP1P1-201ENST00000554337 1009 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC96Q2M329 SETSIP-202ENST00000596516 909 ntAPPRIS P2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC96Q2M329 AC079791.1-201ENST00000605356 973 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC96Q2M329 CHD2-202ENST00000420239 2221 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC96Q2M329 AP000473.2-201ENST00000602659 1537 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC96Q2M329 CLCN3-201ENST00000347613 3635 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC96Q2M329 AC019197.1-201ENST00000638199 3611 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC96Q2M329 SRRM1P3-201ENST00000426911 2678 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC96Q2M329 SLCO1C1-208ENST00000545102 2868 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC96Q2M329 DYRK1A-202ENST00000339659 8654 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC96Q2M329 PCGF5-205ENST00000614189 7037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC96Q2M329 ZNF300P1-202ENST00000520773 3115 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC96Q2M329 PUS3-203ENST00000530811 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
CCDC96Q2M329 PSG7-201ENST00000406070 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
CCDC96Q2M329 ZNF260-204ENST00000592282 5055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
CCDC96Q2M329 TERB1-203ENST00000558713 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CCDC96Q2M329 FBXO9-201ENST00000244426 4559 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
CCDC96Q2M329 ARHGEF12-213ENST00000532993 8753 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
CCDC96Q2M329 MAPK10-338ENST00000641647 3362 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CCDC96Q2M329 RXFP1-203ENST00000343542 2130 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
CCDC96Q2M329 U3.25-201ENST00000391209 220 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CCDC96Q2M329 LINC00446-201ENST00000414743 459 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CCDC96Q2M329 AC099654.1-202ENST00000415836 564 ntTSL 4 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CCDC96Q2M329 RPS3AP38-201ENST00000435889 763 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CCDC96Q2M329 LINC01133-202ENST00000443364 1266 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CCDC96Q2M329 OR7E116P-201ENST00000448529 957 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CCDC96Q2M329 AC105021.1-201ENST00000455347 590 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CCDC96Q2M329 AC112495.1-201ENST00000456037 756 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CCDC96Q2M329 AC007003.1-201ENST00000472463 736 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
CCDC96Q2M329 OSMR-AS1-201ENST00000506463 800 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CCDC96Q2M329 AC105384.2-201ENST00000508433 640 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CCDC96Q2M329 TOMM22P4-201ENST00000511318 336 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CCDC96Q2M329 MRPS16P1-201ENST00000523462 412 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CCDC96Q2M329 AC025857.1-201ENST00000525252 377 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CCDC96Q2M329 AL049872.1-201ENST00000556323 322 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CCDC96Q2M329 AC096996.1-201ENST00000563813 325 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
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