Protein–RNA interactions for Protein: Q16795

NDUFA9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA9Q16795 NPM1P18-201ENST00000434232 732 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
NDUFA9Q16795 SUMO2P3-201ENST00000438311 288 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
NDUFA9Q16795 AC079117.1-201ENST00000445178 1000 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
NDUFA9Q16795 AC023271.1-201ENST00000445936 1090 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
NDUFA9Q16795 CD200R1L-202ENST00000448932 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
NDUFA9Q16795 AL356309.2-201ENST00000454034 719 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
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NDUFA9Q16795 AC012629.1-201ENST00000503953 342 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
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NDUFA9Q16795 AC040173.1-201ENST00000572479 580 ntTSL 4 BASIC5.38□□□□□ -1.55
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NDUFA9Q16795 AQP9-202ENST00000536493 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
NDUFA9Q16795 RNF20-202ENST00000389120 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
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NDUFA9Q16795 AC114786.1-201ENST00000512892 1415 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
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NDUFA9Q16795 URI1-201ENST00000360605 1579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
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NDUFA9Q16795 PTPRZ1-201ENST00000393386 8175 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
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NDUFA9Q16795 AC006145.1-201ENST00000439234 2651 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
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NDUFA9Q16795 LINC01091-203ENST00000514823 5262 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
NDUFA9Q16795 KIAA1328-202ENST00000586135 1863 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
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NDUFA9Q16795 SERPINB7-207ENST00000546027 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
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NDUFA9Q16795 SLC35A5-206ENST00000492406 4399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
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NDUFA9Q16795 AL358975.1-203ENST00000413352 2932 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
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NDUFA9Q16795 RNU4-2-201ENST00000365668 141 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
NDUFA9Q16795 MIR551A-201ENST00000385042 96 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
NDUFA9Q16795 AC012499.1-201ENST00000412133 741 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
NDUFA9Q16795 RANP7-201ENST00000418085 644 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
NDUFA9Q16795 LINC01203-201ENST00000419566 580 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
NDUFA9Q16795 Z98742.1-201ENST00000419801 632 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
NDUFA9Q16795 OR10T1P-201ENST00000424327 947 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
NDUFA9Q16795 VTI1BP4-201ENST00000427516 527 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
NDUFA9Q16795 AP001604.1-201ENST00000447384 954 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
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