Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 ZNF345-215ENST00000614069 3103 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
NRF1Q16656 OAZ3-204ENST00000479764 3789 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
NRF1Q16656 OR4F5-202ENST00000641515 2618 ntAPPRIS P1 BASIC5.3□□□□□ -1.56
NRF1Q16656 AC027088.4-201ENST00000611559 1947 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
NRF1Q16656 AL390726.6-201ENST00000637760 1654 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
NRF1Q16656 AC139426.3-201ENST00000605648 2059 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
NRF1Q16656 BAZ2B-203ENST00000392782 8058 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
NRF1Q16656 HSPA8P14-201ENST00000552265 1805 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
NRF1Q16656 AL078621.3-201ENST00000623707 2042 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
NRF1Q16656 OTUD4-202ENST00000454497 7069 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
NRF1Q16656 MTERF1-203ENST00000419292 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
NRF1Q16656 AC018557.1-201ENST00000569274 1790 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
NRF1Q16656 VPS41-203ENST00000395969 3181 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
NRF1Q16656 ZNF347-202ENST00000452676 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
NRF1Q16656 ASAH2-204ENST00000447815 2311 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
NRF1Q16656 SNW1-204ENST00000554775 1687 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
NRF1Q16656 AC010099.4-201ENST00000424515 1453 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
NRF1Q16656 C1orf162-201ENST00000343534 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
NRF1Q16656 RNA5SP241-201ENST00000391326 114 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NRF1Q16656 RNU6-233P-201ENST00000410845 141 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NRF1Q16656 RN7SKP29-201ENST00000410957 272 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NRF1Q16656 AP000221.1-201ENST00000419694 1046 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
NRF1Q16656 TNKS2-AS1-201ENST00000432246 609 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
NRF1Q16656 AC023481.1-201ENST00000435368 938 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
NRF1Q16656 TUBB4BP6-201ENST00000437576 479 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NRF1Q16656 AC073465.2-201ENST00000440938 498 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NRF1Q16656 AL139275.1-201ENST00000447315 824 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
NRF1Q16656 LINC01456-201ENST00000453902 708 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
NRF1Q16656 AC004692.2-201ENST00000457315 355 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
NRF1Q16656 ENPP7P11-201ENST00000505915 627 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NRF1Q16656 GAPDHP71-201ENST00000511530 1003 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NRF1Q16656 AC097537.1-201ENST00000514864 1213 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
NRF1Q16656 SCARNA18.1-201ENST00000516330 83 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NRF1Q16656 RN7SKP238-201ENST00000516483 249 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NRF1Q16656 NSMCE2-202ENST00000517315 996 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
NRF1Q16656 IGLV3-24-201ENST00000517477 197 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NRF1Q16656 TMEM97P2-201ENST00000517841 403 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NRF1Q16656 AP006259.1-201ENST00000528520 561 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
NRF1Q16656 AL355075.2-201ENST00000555435 478 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
NRF1Q16656 AC093524.1-201ENST00000564266 1094 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NRF1Q16656 ABHD15-AS1-201ENST00000581474 187 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
NRF1Q16656 AL139041.1-201ENST00000605480 610 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NRF1Q16656 AC079906.1-201ENST00000621214 815 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
NRF1Q16656 LINC00506-201ENST00000628435 525 ntTSL 4 BASIC5.29□□□□□ -1.56
NRF1Q16656 MED13-201ENST00000397786 10465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
NRF1Q16656 ESRRG-204ENST00000361525 5363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
NRF1Q16656 ELF1-204ENST00000625359 2032 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
NRF1Q16656 TRPC4-203ENST00000358477 2955 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
NRF1Q16656 MYO9A-203ENST00000444904 7749 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
NRF1Q16656 AC083899.1-201ENST00000454465 3819 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NRF1Q16656 PROM1-220ENST00000540805 3908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
NRF1Q16656 AC010531.4-202ENST00000569872 1718 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
NRF1Q16656 RAP1GDS1-202ENST00000339360 2092 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
NRF1Q16656 KCNJ16-202ENST00000392670 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
NRF1Q16656 ECT2L-201ENST00000367682 4343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
NRF1Q16656 MFAP1-201ENST00000267812 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
NRF1Q16656 PCDH15-206ENST00000373965 9237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
NRF1Q16656 OR9K1P-201ENST00000326513 941 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
NRF1Q16656 AC090616.2-201ENST00000358484 431 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
NRF1Q16656 APOA2-201ENST00000367990 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
NRF1Q16656 SNORA17A-201ENST00000391185 133 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
NRF1Q16656 AL121878.1-201ENST00000418638 859 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
NRF1Q16656 AC092920.1-201ENST00000428516 678 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
NRF1Q16656 RPL23AP19-201ENST00000436229 369 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
NRF1Q16656 PSAT1P4-201ENST00000466500 526 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
NRF1Q16656 AC023424.1-201ENST00000496058 459 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
NRF1Q16656 SEMA6A-AS1-202ENST00000508424 862 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
NRF1Q16656 AC011411.1-201ENST00000509592 876 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
NRF1Q16656 AC074255.1-201ENST00000511259 501 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
NRF1Q16656 SETP21-201ENST00000514799 892 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
NRF1Q16656 AP002815.1-201ENST00000533740 386 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
NRF1Q16656 AC006530.1-201ENST00000555980 571 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
NRF1Q16656 C15orf41-204ENST00000562877 764 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
NRF1Q16656 AC105036.1-201ENST00000566222 271 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
NRF1Q16656 AC074050.3-201ENST00000569175 441 ntTSL 4 BASIC5.28□□□□□ -1.56
NRF1Q16656 AL359715.3-201ENST00000569267 2123 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
NRF1Q16656 AC005288.1-201ENST00000582842 860 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
NRF1Q16656 AC117569.1-201ENST00000584482 739 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
NRF1Q16656 AC011445.2-201ENST00000599274 173 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
NRF1Q16656 AC100767.2-201ENST00000604840 693 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
NRF1Q16656 BX323046.1-201ENST00000610145 535 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
NRF1Q16656 NADK2-211ENST00000617628 744 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
NRF1Q16656 SNORA17.5-201ENST00000630429 132 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
NRF1Q16656 ZNF410-211ENST00000555044 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
NRF1Q16656 KARSP1-201ENST00000451871 1752 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
NRF1Q16656 AC139769.2-201ENST00000599944 2291 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
NRF1Q16656 ANO6-205ENST00000441606 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
NRF1Q16656 AC005154.1-228ENST00000454922 1405 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
NRF1Q16656 LINC00615-201ENST00000546725 1406 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
NRF1Q16656 ERP27-201ENST00000266397 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
NRF1Q16656 AF287957.1-201ENST00000607368 1595 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
NRF1Q16656 AL603750.1-201ENST00000624216 1717 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
NRF1Q16656 AC093591.2-201ENST00000565254 3843 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
NRF1Q16656 AC005261.6-201ENST00000623072 1387 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
NRF1Q16656 GSTM2-206ENST00000442650 1478 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
NRF1Q16656 OBSCN-214ENST00000636875 23907 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
NRF1Q16656 FGF13-202ENST00000315930 19519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
NRF1Q16656 OR7E25P-201ENST00000344844 931 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
NRF1Q16656 RNA5SP500-201ENST00000364486 119 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
NRF1Q16656 HEATR1-201ENST00000366579 793 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.8 ms