Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 AC007956.1-201ENST00000555623 542 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 AL845552.1-201ENST00000556820 323 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 AL356801.1-201ENST00000559320 294 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 MIR4260-201ENST00000583107 67 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 AP001011.1-201ENST00000583546 690 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 MIR6793-201ENST00000612376 63 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 NADK2-211ENST00000617628 744 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 AL031665.2-201ENST00000620712 209 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 MIR325HG-202ENST00000626832 598 ntTSL 4 BASIC6.2□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 AC239809.3-202ENST00000628902 686 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 GHR-210ENST00000615111 4814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 SLFN12L-205ENST00000628453 1767 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 FBXL13-207ENST00000455112 2274 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 AP001642.1-201ENST00000624727 2117 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 AKAP6-212ENST00000557272 4601 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 AP005432.1-201ENST00000580891 3485 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 FGF1-215ENST00000619447 3818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.2□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 OR8B3-202ENST00000641139 2170 ntAPPRIS P1 BASIC6.2□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 RANBP3L-204ENST00000515759 1532 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 TSPAN6-204ENST00000612152 3796 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 NR1H5P-201ENST00000452683 1377 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 MAPK6PS2-201ENST00000379571 2060 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 SMARCA2-206ENST00000382185 1584 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 AC104623.2-202ENST00000623477 4002 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 ZBED6-201ENST00000545588 7979 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 ABI1-210ENST00000376170 3362 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 GPR89A-213ENST00000534502 1644 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 BLZF1-203ENST00000367808 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 POU1F1-201ENST00000344265 1149 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 AL121886.1-201ENST00000358609 435 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 TRDC-201ENST00000390477 720 ntAPPRIS P1 BASIC6.19□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 PMCHL1-204ENST00000430902 659 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 AC126120.1-201ENST00000431082 470 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 VN1R110P-201ENST00000438988 971 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 LINC01781-202ENST00000443104 591 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 PPIAP27-201ENST00000453800 265 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 RPL36A-206ENST00000471855 399 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 AC092916.1-201ENST00000497896 411 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 AC074255.1-201ENST00000511259 501 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 RN7SKP70-201ENST00000516655 271 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 RN7SKP183-201ENST00000517169 324 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 CETN3-206ENST00000522864 738 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 AC084121.1-201ENST00000533882 835 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 AC078820.1-201ENST00000548702 742 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 RPL36A-209ENST00000553110 429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 AC009562.1-202ENST00000558755 565 ntTSL 4 BASIC6.19□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 AGGF1P7-201ENST00000562369 913 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 AC092123.1-202ENST00000565310 405 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 RN7SL290P-201ENST00000578661 300 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 AC117569.1-201ENST00000584482 739 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 AC006272.2-201ENST00000594725 163 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 AL589935.1-201ENST00000602418 488 ntTSL 4 BASIC6.19□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 FAM27E4-201ENST00000605259 342 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 RNU6-84P-201ENST00000607737 102 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 AP001437.1-201ENST00000608783 456 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 Metazoa_SRP.70-201ENST00000612622 273 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 MIR6806-201ENST00000622141 64 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 AC091932.2-201ENST00000623014 291 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 NEK3-211ENST00000629912 141 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 LINC00969-332ENST00000630874 738 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 AC092329.4-204ENST00000639327 549 ntTSL 4 BASIC6.19□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 DNA2-201ENST00000358410 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 NCOA7-202ENST00000368357 5521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
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SYCP1Q15431 ATRX-202ENST00000395603 10218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 RWDD2A-201ENST00000369724 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 BNIP2-202ENST00000415213 1509 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 DST-202ENST00000312431 17756 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 TBC1D23-201ENST00000344949 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 MATR3-228ENST00000620916 3134 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 RALGAPB-202ENST00000397040 8435 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
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SYCP1Q15431 TET2-203ENST00000380013 9679 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 LINC01689-201ENST00000416218 2007 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 ROS1-201ENST00000368507 7417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 PRTG-201ENST00000389286 11967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 RPGRIP1L-201ENST00000262135 8195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 NOSTRIN-206ENST00000444448 2537 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 ST8SIA4-201ENST00000231461 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 OR5B12-201ENST00000302572 1054 ntAPPRIS P1 BASIC6.18□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 VN1R12P-201ENST00000403778 876 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 MIR1275-201ENST00000408770 80 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 RN7SKP286-201ENST00000410894 299 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 LYST-AS1-201ENST00000412098 521 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 AC013472.2-201ENST00000416226 306 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 FO393401.1-203ENST00000416260 486 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 PLA2G12AP2-201ENST00000424744 264 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 AC074011.1-201ENST00000431376 581 ntTSL 4 BASIC6.18□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 TMEM183AP1-205ENST00000432739 290 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 AL021937.3-201ENST00000446543 361 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 RAET1E-AS1-201ENST00000446954 491 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 AC132807.1-201ENST00000449613 458 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 PRPF38AP1-201ENST00000451976 933 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 AL122020.1-201ENST00000472287 459 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 SH3GLB1-202ENST00000482504 1199 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 AC073610.1-201ENST00000489971 396 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 RBBP4P1-201ENST00000502424 1276 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 AC139720.1-201ENST00000509497 512 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 AC079064.1-201ENST00000528365 362 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 AC007406.1-201ENST00000544067 315 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
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