Protein–RNA interactions for Protein: Q15399

TLR1, Toll-like receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR1Q15399 AC244196.3-201ENST00000614171 374 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
TLR1Q15399 HTR1DP1-201ENST00000616500 888 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
TLR1Q15399 Metazoa_SRP.99-201ENST00000621370 254 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
TLR1Q15399 AL161457.2-201ENST00000629181 630 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
TLR1Q15399 CRYM-AS1-204ENST00000637983 556 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
TLR1Q15399 EEF1A1P3-201ENST00000417549 1385 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
TLR1Q15399 AC092725.2-201ENST00000567658 1389 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
TLR1Q15399 ARL6-204ENST00000463745 4231 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
TLR1Q15399 RARSP1-201ENST00000542842 1418 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
TLR1Q15399 ZNF763-202ENST00000358987 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
TLR1Q15399 ATL2-202ENST00000402054 1883 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
TLR1Q15399 FAT2-201ENST00000261800 14534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
TLR1Q15399 CA5B-201ENST00000318636 6835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
TLR1Q15399 SOX6-211ENST00000528429 2656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
TLR1Q15399 DDX24-201ENST00000330836 2738 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
TLR1Q15399 PRRC1-204ENST00000512635 2726 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
TLR1Q15399 LRRIQ3-201ENST00000354431 2849 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
TLR1Q15399 AL133243.4-201ENST00000623116 3109 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
TLR1Q15399 ZNF337-201ENST00000252979 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
TLR1Q15399 LINC00907-201ENST00000585627 3324 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
TLR1Q15399 SPATA31C1-201ENST00000420021 3895 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
TLR1Q15399 AC123769.2-201ENST00000624332 5984 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
TLR1Q15399 CD160-205ENST00000616463 3388 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
TLR1Q15399 PIWIL2-205ENST00000611073 2864 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
TLR1Q15399 CYP2C18-201ENST00000285979 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
TLR1Q15399 DMTF1-213ENST00000432937 2411 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
TLR1Q15399 TLR3-202ENST00000504367 2310 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
TLR1Q15399 AP002833.3-201ENST00000625075 2265 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
TLR1Q15399 IKZF3-215ENST00000535189 1996 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
TLR1Q15399 ZNF300P1-201ENST00000356555 1822 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
TLR1Q15399 EEF1A1P12-201ENST00000443590 1346 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
TLR1Q15399 MOCS2-203ENST00000450852 1337 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
TLR1Q15399 AC022819.1-201ENST00000563495 3910 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
TLR1Q15399 GZMA-201ENST00000274306 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
TLR1Q15399 TTC9C-202ENST00000316461 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
TLR1Q15399 DYNLRB1-202ENST00000357156 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
TLR1Q15399 RABGGTB-202ENST00000370826 512 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
TLR1Q15399 SSX9-201ENST00000376909 591 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
TLR1Q15399 Y_RNA.460-201ENST00000384255 102 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
TLR1Q15399 MIR301B-201ENST00000390813 78 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
TLR1Q15399 RNA5SP185-201ENST00000390963 114 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
TLR1Q15399 AAMDC-202ENST00000393427 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
TLR1Q15399 AL034403.1-201ENST00000399414 885 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
TLR1Q15399 AL451048.1-201ENST00000413328 217 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
TLR1Q15399 AL138831.1-201ENST00000415144 209 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
TLR1Q15399 AC092042.2-201ENST00000417304 331 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
TLR1Q15399 AL022100.1-202ENST00000421214 548 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
TLR1Q15399 AL445524.1-205ENST00000425412 392 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
TLR1Q15399 HSPD1P12-201ENST00000429127 1069 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
TLR1Q15399 AC008067.1-203ENST00000430876 359 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
TLR1Q15399 AL139230.1-201ENST00000440094 425 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
TLR1Q15399 LINC02384-202ENST00000441255 567 ntTSL 4 BASIC7.39□□□□□ -1.23
TLR1Q15399 AC068707.1-201ENST00000451438 391 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
TLR1Q15399 AC114755.1-201ENST00000453101 868 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
TLR1Q15399 AC008080.2-201ENST00000455149 577 ntTSL 4 BASIC7.39□□□□□ -1.23
TLR1Q15399 OFD1P4Y-201ENST00000455273 1179 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
TLR1Q15399 ATP5J-207ENST00000457143 589 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
TLR1Q15399 snoU109.1-201ENST00000459339 135 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
TLR1Q15399 RN7SL213P-201ENST00000463482 317 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
TLR1Q15399 AC092757.1-201ENST00000467293 467 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
TLR1Q15399 AC104831.1-201ENST00000470024 444 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
TLR1Q15399 RPL7AP26-201ENST00000488538 813 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
TLR1Q15399 AC084871.2-201ENST00000503355 464 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
TLR1Q15399 AC073648.3-201ENST00000504939 925 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
TLR1Q15399 AC011352.3-201ENST00000505162 593 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
TLR1Q15399 AC022296.2-201ENST00000512424 202 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
TLR1Q15399 AC097103.2-205ENST00000515247 567 ntTSL 4 BASIC7.39□□□□□ -1.23
TLR1Q15399 AC018682.2-201ENST00000517716 399 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
TLR1Q15399 AC091096.1-201ENST00000521955 614 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
TLR1Q15399 RRAS2-210ENST00000534746 993 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
TLR1Q15399 LINC02289-202ENST00000556781 861 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
TLR1Q15399 FDPSP3-201ENST00000556903 1013 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
TLR1Q15399 AC090971.3-201ENST00000557871 1041 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
TLR1Q15399 DIAPH2-AS1-204ENST00000579945 974 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
TLR1Q15399 MIR3671-201ENST00000580455 88 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
TLR1Q15399 AC008770.1-206ENST00000589551 523 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
TLR1Q15399 AC005757.1-201ENST00000591432 472 ntTSL 4 BASIC7.39□□□□□ -1.23
TLR1Q15399 AC005387.1-201ENST00000597837 352 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
TLR1Q15399 AL139286.1-201ENST00000604465 483 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
TLR1Q15399 AL133351.5-201ENST00000612789 106 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
TLR1Q15399 AC116165.3-201ENST00000614524 400 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
TLR1Q15399 Metazoa_SRP.123-201ENST00000616695 286 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
TLR1Q15399 CR392039.3-201ENST00000623236 227 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
TLR1Q15399 ZRANB2-AS2-221ENST00000624050 629 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
TLR1Q15399 AC079228.1-201ENST00000624774 1049 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
TLR1Q15399 FRMD4B-210ENST00000478263 3761 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
TLR1Q15399 FAR2P1-201ENST00000325390 3679 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
TLR1Q15399 MEIS1-209ENST00000488550 5111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
TLR1Q15399 AC126773.4-201ENST00000612545 3043 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
TLR1Q15399 ARRDC3-201ENST00000265138 4188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
TLR1Q15399 PLPPR1-202ENST00000395056 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
TLR1Q15399 GPR1-AS-201ENST00000623040 3708 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
TLR1Q15399 STXBP4-202ENST00000398391 2160 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
TLR1Q15399 GABRA6-201ENST00000274545 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
TLR1Q15399 TLR10-204ENST00000506111 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
TLR1Q15399 RASGRP3-202ENST00000403687 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
TLR1Q15399 PICALM-201ENST00000356360 1958 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
TLR1Q15399 AIFM1-205ENST00000460436 1925 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
TLR1Q15399 ZNF430-203ENST00000595401 3021 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
TLR1Q15399 KLHL8-203ENST00000498875 5175 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124.9 ms