Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 FUT9-201ENST00000302103 12783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 BRIP1-202ENST00000577598 3969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 GAS2L3-202ENST00000537247 2742 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 STARD4-201ENST00000296632 4606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 CD80-204ENST00000478182 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 ACE2-201ENST00000252519 3393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 ACSL5-204ENST00000393081 3380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 SELENOWP1-201ENST00000322792 252 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 CLEC4A-203ENST00000352620 615 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 TEX35-202ENST00000367639 785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 ST3GAL3-212ENST00000372362 468 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 CD52-201ENST00000374213 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 AC005042.1-201ENST00000393397 800 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 PSMA6P1-201ENST00000400275 741 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 RPL21P67-201ENST00000402896 478 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 CEACAM1-208ENST00000403461 1263 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 ATF2-205ENST00000409499 801 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 AC104463.1-201ENST00000411431 365 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 AL512353.1-202ENST00000416809 627 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 AC013470.3-201ENST00000420252 1194 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 AC021035.1-201ENST00000421597 427 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 OR5K2-201ENST00000427338 1060 ntAPPRIS P1 BASIC4.65□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 AC092811.1-201ENST00000428642 397 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 PMCHL1-204ENST00000430902 659 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 MTND6P18-201ENST00000439477 513 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 AL583839.2-201ENST00000443716 641 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 BMS1P10-201ENST00000443754 1120 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 AC234771.2-201ENST00000445718 597 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 AL590399.3-202ENST00000448491 495 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 AC063955.1-201ENST00000462872 685 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 CREM-220ENST00000463314 964 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 RN7SL393P-201ENST00000463588 296 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 AP000797.2-201ENST00000475768 606 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 AC099521.1-201ENST00000482557 334 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 LINC00518-204ENST00000491317 1228 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 MYL12BP2-201ENST00000503948 512 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 AC010260.1-201ENST00000511484 664 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 AC131935.1-201ENST00000524621 333 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 FAU-203ENST00000525297 355 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 PMS2P3-207ENST00000529061 717 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 AC006349.1-201ENST00000555526 235 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 AC026462.3-201ENST00000565153 557 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 AL049829.3-202ENST00000604278 711 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 AL513314.2-204ENST00000619187 459 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 AC091059.2-201ENST00000623355 614 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 LINC01613-201ENST00000561476 2780 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 GRIK2-204ENST00000369137 4272 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 SSR1-202ENST00000397511 3248 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 AL513548.1-201ENST00000562904 1724 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 KCNJ6-201ENST00000609713 19645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 FOXP1-IT1-201ENST00000498714 3539 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 AC022417.1-201ENST00000624768 1303 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 RNF217-202ENST00000368414 1771 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 AC092821.1-204ENST00000518709 3552 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 CSMD3-203ENST00000343508 13018 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 LRRTM4-203ENST00000409282 2451 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 PRLR-220ENST00000620785 11063 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 TESPA1-203ENST00000524622 4188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 GPR87-201ENST00000260843 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 LEKR1-201ENST00000356539 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 ENPP2-207ENST00000522167 1695 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 ATP8B4-201ENST00000284509 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 SRSF11-201ENST00000370949 3034 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 ANKRD46-204ENST00000519597 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 EMC2-201ENST00000220853 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 REP15-201ENST00000310791 1078 ntAPPRIS P1 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 RN7SKP77-201ENST00000363261 353 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 TYRP1-201ENST00000381136 872 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 SNORD56.6-201ENST00000384569 71 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 SNORA48.4-201ENST00000391089 134 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 AL078599.1-201ENST00000402075 293 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 LINC01661-201ENST00000415910 708 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 AC114803.1-201ENST00000417355 311 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 KIF4CP-201ENST00000422742 1279 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 AC008164.1-201ENST00000423925 564 ntTSL 4 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 AL354989.1-201ENST00000448245 635 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 MTND6P5-201ENST00000448266 512 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 AC009518.1-201ENST00000452219 559 ntTSL 4 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 AC013549.1-201ENST00000454086 566 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 AP002453.1-201ENST00000492327 668 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 LINC02360-201ENST00000506195 657 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 LINC02039-201ENST00000507428 566 ntTSL 4 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 AC011411.1-201ENST00000509592 876 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 AC096576.2-201ENST00000511835 948 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 ZNF519P4-201ENST00000514008 125 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 SPRY4-AS1-205ENST00000514303 152 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 AC134511.1-201ENST00000535721 192 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 AC008149.1-201ENST00000551844 525 ntTSL 4 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 DHFRP1-201ENST00000579682 559 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 AC025809.1-201ENST00000585336 560 ntTSL 4 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 SLC14A2-AS1-204ENST00000592899 359 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 IGKV2OR2-7D-201ENST00000603664 304 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 AC233280.2-201ENST00000603917 1070 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 IGKV2OR2-7-201ENST00000604652 304 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 AL133406.3-201ENST00000606817 541 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 AL589182.1-201ENST00000611785 320 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 AL080312.2-201ENST00000613001 630 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 AC089999.3-201ENST00000622440 577 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 AC244205.1-201ENST00000624935 705 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 AC245187.2-201ENST00000631520 475 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
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