Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 LAPTM4BP1-201ENST00000447781 690 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 AL161912.1-201ENST00000448475 524 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 Z99127.1-201ENST00000452442 670 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 AC135721.2-201ENST00000464237 300 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 RPS14P8-201ENST00000478778 369 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 RN7SL187P-201ENST00000495587 303 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 AC099509.1-201ENST00000502437 652 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 C4orf33-204ENST00000502887 1126 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 SUMO2P4-201ENST00000504193 276 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 AC093770.1-201ENST00000511559 571 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 AC109471.1-201ENST00000511631 612 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 AC097494.1-201ENST00000512898 732 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 LINC02055-205ENST00000521090 774 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 AP001831.1-201ENST00000524610 411 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 AC118273.2-201ENST00000532092 465 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 OR4A21P-201ENST00000532759 944 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 AP002765.2-201ENST00000532961 666 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 AC016957.1-201ENST00000534895 309 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 AC007686.2-201ENST00000554043 469 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 AC005519.1-201ENST00000554490 601 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 AC087465.1-201ENST00000560574 245 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 RPL29P33-201ENST00000587474 316 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 AC010327.2-201ENST00000587647 488 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 LINC02104-202ENST00000604954 599 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 LINC00635-219ENST00000608506 482 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 AC009509.4-201ENST00000619202 509 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 MIR6823-201ENST00000622118 61 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 AC061999.1-201ENST00000624454 177 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 AL049767.1-201ENST00000636811 514 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 AL357060.1-201ENST00000638039 977 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 NPHP1-203ENST00000393272 2752 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 SMAD1-202ENST00000394092 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 DEUP1-209ENST00000531792 1656 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 DDX58-202ENST00000379883 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 GYPA-212ENST00000616983 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 PLCH1-203ENST00000447496 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 IL5RA-201ENST00000256452 2001 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 AKAP5-202ENST00000394718 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 KLHL5-202ENST00000261426 3300 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 LMNTD1-202ENST00000413632 1520 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 LINC02073-201ENST00000588341 2845 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 UNC5D-201ENST00000287272 8662 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 TLR7-201ENST00000380659 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 MUC4-209ENST00000463781 17110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 SYT4-201ENST00000255224 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 FO082842.1-201ENST00000423552 1370 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 ENSA-214ENST00000513281 1369 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 LINC01602-201ENST00000522992 2109 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 NEXMIF-203ENST00000616200 10624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 DCP1A-206ENST00000610213 5994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 AP003486.1-201ENST00000525716 3994 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 CFHR5-201ENST00000256785 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 ENSA-201ENST00000271690 2818 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 SYNPO2-203ENST00000434046 3588 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 CDY11P-201ENST00000447168 1651 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 CEBPZ-201ENST00000234170 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 GAPVD1-202ENST00000297933 6003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 EIF1B-201ENST00000232905 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 OR6C2-201ENST00000322678 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.34□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 Y_RNA.41-201ENST00000362646 102 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 Y_RNA.813-201ENST00000364639 102 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 RNA5SP85-201ENST00000365378 119 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 VIM2P-201ENST00000402383 1294 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 OTUD6B-202ENST00000404789 1089 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 AL590635.1-201ENST00000406314 586 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 AC244452.1-201ENST00000413798 141 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 NPM1P11-201ENST00000417106 855 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 MTCYBP38-201ENST00000417160 1123 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 AC010745.4-201ENST00000420130 740 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 AC004074.1-201ENST00000421810 1063 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 AL139184.1-202ENST00000422303 222 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 AL358394.1-201ENST00000422807 535 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 AL031846.1-202ENST00000424436 592 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 CYP4F32P-201ENST00000426492 504 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 FGF12-202ENST00000430714 603 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 AC016582.1-203ENST00000433142 502 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 LINC01797-202ENST00000433432 765 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 AC068888.2-201ENST00000435621 536 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 NDUFS5P5-201ENST00000437256 321 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 NFIA-AS2-203ENST00000438559 1275 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 LINC00366-201ENST00000441430 435 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 AL021937.4-201ENST00000444848 444 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 HMGB3P6-201ENST00000444896 598 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 MTCO1P48-201ENST00000448024 1096 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 EPS15P1-201ENST00000448836 336 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 CCRL1P1-201ENST00000449542 1053 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 MGAT2P1-201ENST00000449718 797 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 RPL7AP23-201ENST00000482625 776 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 RN7SL568P-201ENST00000493069 298 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 AC092045.1-201ENST00000495716 1231 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 TAS2R50-201ENST00000506868 1000 ntAPPRIS P1 BASIC6.34□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 AC112225.1-201ENST00000508230 297 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 AC109458.1-201ENST00000508858 316 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 AC091849.1-201ENST00000509920 121 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 AC010285.3-201ENST00000511668 676 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 NDUFA5P2-201ENST00000519723 344 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 AP002428.1-201ENST00000527345 380 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 AC140063.1-201ENST00000541343 259 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 TMEM116-208ENST00000549537 1229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
SSPNQ14714 C14orf119-202ENST00000554203 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.9 ms