Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 LYST-AS1-201ENST00000412098 521 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CUL4BQ13620 AL669841.1-201ENST00000425723 558 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CUL4BQ13620 AC069154.1-201ENST00000432914 542 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CUL4BQ13620 AC012368.1-201ENST00000438115 552 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CUL4BQ13620 RPSAP37-201ENST00000470913 821 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CUL4BQ13620 ARPP21-231ENST00000474696 572 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CUL4BQ13620 ST20-201ENST00000478497 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
CUL4BQ13620 RPL32P33-201ENST00000487023 394 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CUL4BQ13620 RPL37P23-201ENST00000492641 294 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CUL4BQ13620 NADK2-AS1-201ENST00000501794 720 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
CUL4BQ13620 AC010181.1-202ENST00000509191 798 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CUL4BQ13620 AC139720.1-201ENST00000509497 512 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CUL4BQ13620 AC084855.1-201ENST00000528696 572 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CUL4BQ13620 AC092474.3-201ENST00000603022 568 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CUL4BQ13620 Metazoa_SRP.70-201ENST00000612622 273 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CUL4BQ13620 NADK2-211ENST00000617628 744 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
CUL4BQ13620 SMARCA2-231ENST00000634931 939 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CUL4BQ13620 SSXP3-201ENST00000442971 1300 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CUL4BQ13620 EEF1A1P21-201ENST00000512363 1344 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CUL4BQ13620 AC092451.3-201ENST00000625067 1343 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CUL4BQ13620 ARHGAP20-204ENST00000528829 5880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
CUL4BQ13620 LINC01630-202ENST00000578152 3188 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CUL4BQ13620 C3orf35-203ENST00000425564 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
CUL4BQ13620 PSG7-206ENST00000623675 1392 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
CUL4BQ13620 HIF1AN-201ENST00000299163 13011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
CUL4BQ13620 AL034546.1-201ENST00000623740 3693 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CUL4BQ13620 AC083899.1-201ENST00000454465 3819 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CUL4BQ13620 KYAT3-203ENST00000370491 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CUL4BQ13620 AC016745.2-201ENST00000608834 3443 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CUL4BQ13620 PHC3-217ENST00000497658 2087 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
CUL4BQ13620 IKZF2-201ENST00000342002 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
CUL4BQ13620 ZNF382-201ENST00000292928 8329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
CUL4BQ13620 NELL2-205ENST00000452445 3196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
CUL4BQ13620 SIAH1-202ENST00000380006 3352 ntAPPRIS P3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CUL4BQ13620 BMPR2-204ENST00000638587 3443 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CUL4BQ13620 OR4C11-201ENST00000302231 1045 ntAPPRIS P1 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CUL4BQ13620 RNU4-39P-201ENST00000362455 127 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CUL4BQ13620 SNORA27.3-201ENST00000364937 134 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CUL4BQ13620 MYO3A-202ENST00000376301 727 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CUL4BQ13620 TRAV10-201ENST00000390432 379 ntAPPRIS P1 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CUL4BQ13620 PEX12P1-201ENST00000400284 1048 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CUL4BQ13620 MIR1203-201ENST00000408812 85 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CUL4BQ13620 MIR3681HG-202ENST00000412606 578 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CUL4BQ13620 AL356968.2-201ENST00000412769 1257 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CUL4BQ13620 HAO2-IT1-201ENST00000419144 311 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CUL4BQ13620 AC004882.2-201ENST00000420180 244 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CUL4BQ13620 ODF2-AS1-201ENST00000420801 407 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CUL4BQ13620 AL583785.1-201ENST00000428006 512 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CUL4BQ13620 CA1-201ENST00000431316 1232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CUL4BQ13620 AC138761.5-201ENST00000433967 325 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CUL4BQ13620 AC211433.1-202ENST00000434256 1187 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
CUL4BQ13620 AC007327.2-201ENST00000440788 457 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CUL4BQ13620 LINC01851-201ENST00000443419 637 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CUL4BQ13620 MOB4-207ENST00000448447 1021 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CUL4BQ13620 AC108751.3-201ENST00000461814 1020 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CUL4BQ13620 AC073610.1-201ENST00000489971 396 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CUL4BQ13620 LINC00518-204ENST00000491317 1228 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CUL4BQ13620 AC009120.1-201ENST00000493458 473 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CUL4BQ13620 RPS17P5-201ENST00000498293 408 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CUL4BQ13620 AC108157.1-201ENST00000510511 539 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CUL4BQ13620 HMGN2P36-201ENST00000529541 409 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CUL4BQ13620 AC026894.1-201ENST00000532930 850 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CUL4BQ13620 AC084824.2-201ENST00000548906 345 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CUL4BQ13620 AC087636.1-201ENST00000554787 573 ntTSL 4 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CUL4BQ13620 AC068722.1-202ENST00000559600 655 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CUL4BQ13620 AC009120.4-201ENST00000564455 513 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CUL4BQ13620 AC006504.5-201ENST00000588122 655 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CUL4BQ13620 SNHG8-202ENST00000602483 309 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CUL4BQ13620 AL138900.3-201ENST00000607010 629 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CUL4BQ13620 MIR325HG-202ENST00000626832 598 ntTSL 4 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CUL4BQ13620 PRKCH-228ENST00000640011 285 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CUL4BQ13620 GRAMD2B-202ENST00000502348 1363 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CUL4BQ13620 MAMDC2-AS1-201ENST00000377178 1504 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
CUL4BQ13620 PSG9-202ENST00000270077 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
CUL4BQ13620 CDON-206ENST00000531738 5803 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
CUL4BQ13620 UGT2B17-201ENST00000317746 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
CUL4BQ13620 AC006145.1-201ENST00000439234 2651 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CUL4BQ13620 SCN2A-207ENST00000631182 8430 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CUL4BQ13620 PCGF5-205ENST00000614189 7037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
CUL4BQ13620 RNF213-204ENST00000508628 17730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CUL4BQ13620 DTNA-230ENST00000598334 3201 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
CUL4BQ13620 AC068870.1-201ENST00000563737 2455 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CUL4BQ13620 KCNC4-201ENST00000369787 18750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
CUL4BQ13620 ALKBH3-AS1-201ENST00000499194 1906 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CUL4BQ13620 RALYL-211ENST00000523850 1684 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CUL4BQ13620 AC007491.1-202ENST00000637961 1576 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CUL4BQ13620 SAMM50P1-201ENST00000455403 1399 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CUL4BQ13620 SLC9B1P1-201ENST00000331172 1337 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CUL4BQ13620 MTHFD2P5-201ENST00000320415 844 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CUL4BQ13620 SVIL-AS1-202ENST00000414457 1243 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
CUL4BQ13620 REREP1Y-201ENST00000422655 198 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CUL4BQ13620 HNRNPA1P29-201ENST00000426409 879 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CUL4BQ13620 MTCO1P45-201ENST00000431457 267 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CUL4BQ13620 REREP2Y-201ENST00000439103 200 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CUL4BQ13620 MED28P3-201ENST00000444288 531 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CUL4BQ13620 AL049649.1-201ENST00000444792 1105 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CUL4BQ13620 MEMO1P4-201ENST00000453590 386 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CUL4BQ13620 AC105918.1-201ENST00000474399 838 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CUL4BQ13620 STRADBP1-201ENST00000478954 1281 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CUL4BQ13620 GLUD1P3-202ENST00000508551 200 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
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