Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 AC093325.1-201ENST00000508378 326 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 NREP-223ENST00000515855 801 ntTSL 4 BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 RNU6-405P-201ENST00000516637 110 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 RN7SKP11-201ENST00000517018 287 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 AP000426.1-201ENST00000518749 361 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 AC008705.1-201ENST00000518837 489 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 KCNU1-202ENST00000518904 334 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 HDAC2-AS2-209ENST00000519270 1244 ntTSL 4 BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 CARSP2-201ENST00000520688 277 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 LRFN5-203ENST00000554120 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 AL049830.4-201ENST00000555149 351 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 AC009396.2-201ENST00000555954 700 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 PSMA3-213ENST00000557508 814 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 IDH3A-223ENST00000561366 389 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 RAB27A-205ENST00000564609 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 AC023827.2-201ENST00000566880 1061 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 AL359715.3-201ENST00000569267 2123 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 AC037487.4-201ENST00000577423 625 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 AC090371.2-205ENST00000580366 490 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 LINC01900-202ENST00000584898 603 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 AC012593.1-213ENST00000587255 510 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 AC005837.2-201ENST00000587459 479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 RPS27AP19-201ENST00000597285 458 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 AC004862.1-203ENST00000598433 1020 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 AL008582.1-201ENST00000609612 442 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 AC107075.1-201ENST00000613695 314 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 MIR6774-201ENST00000614651 70 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 AL353770.4-201ENST00000614936 468 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 AL590491.2-203ENST00000614969 468 ntTSL 4 BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 AC126177.8-201ENST00000618339 1015 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 MSANTD2-204ENST00000526629 3086 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 FBXW12-204ENST00000445170 1379 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 TDRD1-201ENST00000251864 4510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 USP37-203ENST00000415516 4516 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 ZNF849P-201ENST00000594711 1566 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 SCN1A-204ENST00000423058 8191 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 PDGFRA-201ENST00000257290 6576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 HOMEZ-203ENST00000561013 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 AL359313.1-201ENST00000447311 2293 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 AL512310.3-201ENST00000547023 1335 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 AL929601.4-201ENST00000613011 1341 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 CHN1-204ENST00000409597 1445 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 ATP6V1A-201ENST00000273398 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 AC092447.7-201ENST00000422212 1621 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 LGSN-204ENST00000622415 1612 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 ZNF532-224ENST00000591808 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 PAIP1-202ENST00000338972 1814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 ARL14EPL-201ENST00000601302 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 GRXCR2-201ENST00000377976 2002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 LINC01793-201ENST00000409590 2036 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 MELK-210ENST00000543751 2400 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 CASC18-202ENST00000548557 2503 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 TLR1-201ENST00000308979 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 MDM4-216ENST00000616250 9597 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 TGFBR3-207ENST00000525962 3927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 GCSAML-210ENST00000536561 4063 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 RORA-203ENST00000335670 10844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 ANGPTL5-201ENST00000334289 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 RBM28-201ENST00000223073 15507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 AC104662.2-201ENST00000512921 1388 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 OCM2-201ENST00000257627 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 ARCN1-201ENST00000264028 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 OR6C2-201ENST00000322678 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 OR5K4-201ENST00000354924 966 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 Y_RNA.70-201ENST00000362886 110 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 RNA5SP172-201ENST00000365061 118 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 CFHR1-202ENST00000367424 1070 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 DEFB121-202ENST00000376314 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 Y_RNA.408-201ENST00000383987 102 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 TRAV27-201ENST00000390457 425 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 TRAV35-201ENST00000390462 330 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 RNU6-757P-201ENST00000410334 100 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 SEPT7P8-201ENST00000413308 775 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 AC009743.1-201ENST00000415774 610 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 NUCB1-AS1-201ENST00000416432 433 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 YWHAZP5-201ENST00000419975 730 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 IPPKP1-201ENST00000422501 768 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 RPS4XP16-201ENST00000427198 791 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 AC007365.2-201ENST00000428806 458 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 CDY14P-201ENST00000431260 1014 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 ARL6IP1P2-201ENST00000431356 563 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 LINC00390-201ENST00000432331 340 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 LINC00595-203ENST00000432742 683 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 AC009158.1-207ENST00000432973 394 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 MORF4L1P5-201ENST00000433352 961 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 GUSBP6-201ENST00000434932 640 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 MRPS21P3-201ENST00000436696 262 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 AC027124.1-201ENST00000440852 466 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 GTF3AP5-201ENST00000442645 697 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 MTCO1P48-201ENST00000448024 1096 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 AC009244.1-201ENST00000450566 258 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 CDY23P-201ENST00000451661 1014 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 Z99127.1-201ENST00000452442 670 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 AL583803.1-201ENST00000454262 334 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 RPL7P32-201ENST00000457119 744 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 AC016751.1-201ENST00000458254 306 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 TPT1P7-201ENST00000458300 517 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 RPS26P11-201ENST00000463445 348 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 RPS26P6-201ENST00000475156 348 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 PDCL3P4-201ENST00000489621 720 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
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